为研究猪内源性逆转录病毒(PERV)在不同猪种中的分布情况、序列结构、遗传变异、表达特性等特征,本研究选取大白猪、荣昌猪、五指山小型猪3种常见猪种为研究对象,分别设计特异性引物,检测各猪种肺组织中PERV 3种亚型(PERV-A、PERV-B、PERV-C)的分布情况.结果显示,PERV在3种猪种中均有分布,其中PERV-A分布最广泛.进一步分段扩增3种猪的PERV-A全基因组序列并测序分析.全基因组序列进化树与囊膜(env)基因进化树分析均显示,东北地区的大白猪与荣昌猪PERV-A归为同一分支,亲缘关系较近;对测序结果进行生物信息学分析和蛋白二级结构预测,结果显示,PERV-A Gag蛋白和Pol蛋白的变异程度较大,有多种结构,但Env蛋白保守性较高,结构较为单一.采用荧光定量PCR法检测SPF大白猪不同组织中的PERV-A,结果显示从SPF大白猪心、肝、脾、肺、肾、扁桃体、淋巴结等7种组织中均检测出PERV-A,且在扁桃体等免疫器官组织中的转录水平最高.本研究共获得了5条不同猪种的PERV-A全基因组序列,首次鉴定了荣昌猪PERV全基因组序列,提示东北地区大白猪的引种来源可能与韩国猪种存在一定同源性,且五指山小型猪与荣昌猪、大白猪亲缘关系较远,有助于PERV分子特性的研究,并为评估不同猪种PERV在异种移植中的安全性并筛选合适猪种提供参考.

猪内源性逆转录病毒;序列分析;囊膜基因;遗传进化分析

冯天悦;Kamal Shah;张文立;付利芝;李昌文;王玉娥;陈洪岩

东北农业大学生命科学学院,黑龙江 哈尔滨 150030;中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室/黑龙江省实验动物与比较医学重点实验室/国家禽类实验动物资源库,黑龙江 哈尔滨 150069;重庆市畜牧科学研究院兽医兽药研究所,重庆 402460

中国预防兽医学报

[1]冯天悦;Kamal Shah;张文立;付利芝;李昌文;王玉娥;陈洪岩-.猪内源性逆转录病毒在3种不同品系猪中的分布及序列特征研究)[J].中国预防兽医学报,2022(11):1141-1148,1168

猪内源性逆转录病毒,PERV,Gag,韩国猪,囊膜基因

不同品系,序列特征,序列结构,遗传变异,表达特性,大白猪,荣昌猪,五指山小型猪,特异性引物,肺组织,种猪,全基因组序列,测序分析,env,基因进化树,进化树分析,亲缘关系,生物信息学分析,蛋白二级结构,结构预测,Pol,Env,保守性,SPF,不同组织,猪心,扁桃体,淋巴结,免疫器官,转录水平,共获,引种,同源性,较远,分子特性,异种移植,序列分析,遗传进化分析

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