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豆科MIKC型MADS-box基因家族生物信息学分析
文献摘要：
MIKC型MADS-box是一类生物功能丰富的转录因子家族,参与调控植物的生长发育.为深入研究豆科MIKC型MADS-box基因家族生物学特性,利用生物信息学方法在大豆和蒺藜苜蓿中分别鉴定出92和45个MIKC型基因,并将其分为15个亚类.蛋白基序分析发现,大豆与蒺藜苜蓿不同亚类的共同基序不同,基因结构发生变化;共线性分析及KS分析表明,大豆90.5％的基因对和蒺藜苜蓿87.1％的基因对产生于双子叶植物共同经历的三倍化事件之前;大豆基因表达模式分析表明,大豆幼苗期总体表达量高于其他时期,其中SVP、SOC1、AGL12亚类表达量较高;蛋白互作网络分析表明,大豆SVP蛋白与CO、FT和TFL1蛋白相互作用,一起调控植物开花发育.本研究为进一步揭示MADS-box家族基因的生物学功能奠定基础.
文献关键词：
MIKC型MADS-box;转录因子;大豆;进化;表达模式分析
中图分类号：
作者姓名：
张月;王佳琪;于子建;许强;张岚;潘玉欣
作者机构：
华北理工大学生命科学学院,河北唐山,063210
文献出处：
引用格式：
[1]张月;王佳琪;于子建;许强;张岚;潘玉欣-.豆科MIKC型MADS-box基因家族生物信息学分析)[J].中国油料作物学报,2022(04):798-809
A类：
AGL12
B类：
豆科,MIKC,MADS,box,基因家族,生物信息学分析,类生物,生物功能,功能丰富,生物学特性,利用生物,生物信息学方法,蒺藜苜蓿,亚类,基序,基因结构,共线性分析,KS,双子叶,三倍,基因表达模式,表达模式分析,大豆幼苗,幼苗期,SVP,SOC1,蛋白互作网络分析,FT,TFL1,蛋白相互作用,起调,开花,花发育,家族基因,生物学功能
AB值：
0.333007
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