典型文献
大豆FLC-like基因生物信息学分析及开花调控功能解析
文献摘要:
FLC基因编码蛋白是植物开花春化途径中的核心抑制因子,属于MADS-box家族.大豆是不需要春化的作物,大豆FLC基因的功能还有待进一步研究.为了解析大豆FLC基因在开花调控中的功能,本研究利用生物信息学方法对大豆FLC基因进行同源比对分析、蛋白结构分析和组织特异性表达分析,同时验证大豆FLC不同单倍型的开花时间.结果表明:在128个大豆MADS-box基因中鉴定出2个大豆FLC-like基因,GmFLC-like 1(Glyma.05G148700)和 GmFLC-like 2(Glyma.08G105400),其中 GmFLC-like 2 为新发现的大豆 FLC 基因.GmFLC-like 1 和 GmFLC-like 2 均具有1个高度保守的MADS-box结构域、1个较为保守的K-box结构域和不保守的C末端结构域.GmFLC-like 1在叶片、花和果荚的表达量较高,GmFLC-like 2在花、果荚、根和根瘤中表达量较高.通过把424份大豆自然群体材料中GmFLC-like的单倍型与开花期关联分析发现,GmFLC-like1的外显子与GmFLC-like 1和GmFLC-like 2的内含子分别发生单碱基突变后,开花期都显著延迟,表明GmFLC-like 1和GmFLC-like 2可能参与大豆开花期的调控.
文献关键词:
大豆;FLC-like;生物信息学;单倍型;开花期
中图分类号:
作者姓名:
杨璧泽;刘宝辉;汤杨
作者机构:
广州大学生命科学学院,广东广州510006
文献出处:
引用格式:
[1]杨璧泽;刘宝辉;汤杨-.大豆FLC-like基因生物信息学分析及开花调控功能解析)[J].大豆科学,2022(04):427-437
A类:
春化途径,GmFLC,05G148700,08G105400,花期关联分析,like1
B类:
大豆,生物信息学分析,开花调控,调控功能,功能解析,基因编码,编码蛋白,抑制因子,MADS,box,研究利用,利用生物,生物信息学方法,行同,同源比对,比对分析,蛋白结构,组织特异性,特异性表达,表达分析,单倍型,开花时间,Glyma,新发现,结构域,根瘤,开花期,外显子,内含子,单碱基突变
AB值:
0.195445
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