典型文献
蓖麻RcWD40家族鉴定与表达分析
文献摘要:
植物中的WD40蛋白家族通过蛋白质-蛋白质及蛋白质-DNA的互作,参与生物过程,该家族的重要成员TTG1在拟南芥中抑制种子脂肪酸的过早积累.为揭示油料作物蓖麻中RcWD40基因家族及RcTTG1基因的表达特征,利用生物信息学手段在全基因组水平鉴定到182个RcWD40家族成员,其中RcWD40-181为RcTTG1基因,并对它们的系统发育、保守结构域及表达模式等进行分析.根据进化树结构和保守域组成分别将RcWD40家族成员分为8个cluster和28个亚家族.此外,转录组分析显示RcWD40在蓖麻的花、叶、根、茎以及各发育时期种子中具有多样的表达模式,预测家族基因可能调节这些组织的生长发育.启动子区域转录因子结合位点及种子发育表达分析结果预测RcTTG1可能承担与AtTTG1相似的脂肪酸积累负调节功能.
文献关键词:
蓖麻;WD40蛋白;种子发育;表达模式;RcTTG1基因
中图分类号:
作者姓名:
苟亚夫;唐杰松;于耸;郑志民
作者机构:
东北林业大学生命科学学院,东北盐碱植被恢复与重建教育部重点实验室,黑龙江哈尔滨,150040;东北林业大学林学院,林木遗传育种国家重点实验室,黑龙江哈尔滨,150040
文献出处:
引用格式:
[1]苟亚夫;唐杰松;于耸;郑志民-.蓖麻RcWD40家族鉴定与表达分析)[J].中国油料作物学报,2022(02):354-364
A类:
RcWD40,RcTTG1,AtTTG1
B类:
蓖麻,表达分析,白家,生物过程,拟南芥,制种,过早,油料作物,基因家族,表达特征,利用生物,全基因组,系统发育,保守结构域,表达模式,进化树,树结构,cluster,亚家族,转录组分析,发育时期,家族基因,启动子区域,转录因子结合位点,种子发育,调节功能
AB值:
0.265624
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