典型文献
小黑杨PsnbHLH35转录因子基因功能分析
文献摘要：
[目的]bHLH是一类响应环境胁迫和次生代谢调控的转录因子.以小黑杨为试材,探究bHLH35转录因子抗盐胁迫分子机制,对培育抗盐胁迫小黑杨具有现实意义.[方法]提取小黑杨RNA,反转录成cDNA后设计引物克隆PsnbHLH35基因;提取小黑杨DNA克隆PsnbHLH35基因启动子,进行启动子元件预测;使用在线软件对Psnb?HLH35基因进行生物信息学分析;构建pBI121-bHLH35-GFP载体,利用烟草注射的方式进行亚细胞定位分析;构建pGBKT7-bHLH35载体,使用酵母双杂交的方法进行自激活活性检测;取培养1个月的小黑杨水培15 d后,用0.15 mol·L-1 NaCl溶液分别处理0、3、6、12、24、48 h提取DNA进行荧光定量PCR,计算相对表达量并绘制时空表达模型.[结果]以小黑杨为试材,克隆出735 bp的PsnbHLH35基因的cDNA.启动子预测结果显示该基因包含AAGAA-mo-tif、CGTCA-motif、TGACG-motif等多种胁迫应答元件.PsnbHLH35蛋白编码244个氨基酸,编码的蛋白没有信号肽,属于亲水蛋白.蛋白二级结构预测显示该蛋白由54.51％的α-螺旋、2.05％的β-折叠、34.43％的无规则卷曲和9.02％的延伸链所构成.蛋白三级结构预测结果显示该蛋白由碱性区域和"α螺旋1-环-α螺旋2"组成;保守结构域分析证明PsnbHLH35具有bHLH家族的保守结构域;酵母双杂交实验显示,PsnbHLH35不具有自激活活性.亚细胞定位表明,PsnbHLH35为核定位蛋白.利用RT-qPCR发现在盐胁迫后,PsnbHLH35基因在根、叶中表达量有明显提高.[结论]PsnbHLH35是一个定位在细胞核里没有自激活活性的应答盐胁迫的bHLH家族的转录因子.
文献关键词：
小黑杨;bHLH转录因子;盐胁迫应答;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
董立本;王爽;姜廷波;周博如
作者机构：
东北林业大学 林木遗传育种国家重点实验室,黑龙江 哈尔滨 150040
文献出处：
引用格式：
[1]董立本;王爽;姜廷波;周博如-.小黑杨PsnbHLH35转录因子基因功能分析)[J].山西农业大学学报（自然科学版）,2022(04):56-64
A类：
PsnbHLH35,bHLH35,Psnb,HLH35,AAGAA
B类：
小黑杨,基因功能分析,环境胁迫,次生代谢,代谢调控,抗盐,录成,cDNA,引物,基因启动子,生物信息学分析,pBI121,GFP,烟草,亚细胞定位,定位分析,pGBKT7,自激,活活,活性检测,杨水,水培,NaCl,别处,相对表达量,时空表达,表达模型,bp,CGTCA,motif,TGACG,蛋白编码,信号肽,亲水,蛋白二级结构,结构预测,折叠,无规则,卷曲,三级结构,保守结构域,酵母双杂交实验,核定,qPCR,细胞核,盐胁迫应答
AB值：
0.246739
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