典型文献
大白菜COBRA基因家族鉴定及其低温胁迫表达分析
文献摘要：
[目的]鉴定大白菜COBRA基因家族成员,分析基因在低温胁迫下的表达并预测基因功能.[方法]利用生物信息学方法对大白菜的COBRA基因家族进行鉴定,并对基因结构、系统进化、启动子元件和表达模式进行分析.[结果]大白菜COBRA基因家族包含23个成员,命名为BrCOBL1～BrCOBL23,分布于大白菜基因组的8条染色体上,根据基因序列特点将其分为2个亚族.大白菜与同属于十字花科的拟南芥、甘蓝型油菜、甘蓝和芥菜基因组中共鉴定出147个COBRA基因,系统进化树分析表明以上COBRA基因家族成员可聚为8个亚组.基因表达分析显示:低温胁迫下,大白菜BrCOBL1、BrCOBL2、BrCOBL15 和 BrCOBL16 的表达量显著升高.[结论]COBRA蛋白序列含有共同的保守基序,且某些基序特异存在于不同的亚族,表明这些基序可能与各亚族的功能分化有关.根据启动子分析结果推测BrCOBL基因可能参与大白菜的非生物胁迫响应及激素应答调控.
文献关键词：
大白菜;COBRA基因家族;基因表达分析;低温胁迫
中图分类号：
作者姓名：
廉瑞婷;任宏;翟文;陈连水;汤晓辛
作者机构：
贵州师范大学生命科学学院,贵州贵阳550025;东华理工大学化学生物与材料科学学院,江西南昌330013
文献出处：
引用格式：
[1]廉瑞婷;任宏;翟文;陈连水;汤晓辛-.大白菜COBRA基因家族鉴定及其低温胁迫表达分析)[J].云南农业大学学报（自然科学）,2022(06):1031-1039
A类：
BrCOBL1,BrCOBL23,BrCOBL2,BrCOBL15,BrCOBL16,BrCOBL
B类：
大白菜,COBRA,基因家族鉴定,低温胁迫,基因功能,利用生物,生物信息学方法,基因结构,表达模式,基因序列,列特,点将,同属,十字花科,拟南芥,甘蓝型油菜,芥菜,系统进化树分析,基因表达分析,保守基序,启动子分析,非生物胁迫,胁迫响应,激素应答
AB值：
0.190608
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