典型文献
油菜F-box-LRR基因全基因组鉴定与核盘菌诱导应答分析
文献摘要：
由核盘菌引起的菌核病是一种重要的真菌性病害,筛选菌核病抗病基因对抗病育种具有重要意义.F-box基因多参与植物抗逆反应,LRR作为抗病基因的重要结构域,在植物抗病防卫中起着重要的作用.本研究通过生物信息学方法在甘蓝型油菜基因组中对F-box-LRR基因进行了全基因组鉴定,基于已发表的中双11组织表达数据以及油菜不同品种中油821(抗病)和Westar(感病)接种核盘菌前后的转录组数据,对可能响应核盘菌诱导的BnF-box-LRR基因进行筛选,并结合荧光定量PCR进行验证.共鉴定到161个BnF-box-LRR基因,从系统进化树上可分为4个亚类(FBXLRR1,FBXLRR2,FBXLRR3和FBXLRR4),其中第四亚类FBXLRR4在蛋白保守序列分布以及基因结构方面,与其它三个亚类具有较大差异,且与拟南芥参与植物抗逆的同源基因聚为一类,因此推测该分支可能主要参与植物胁迫响应.表达分析表明FBXLRR4家族基因在根和叶中有较高的表达水平,且在核盘菌诱导后具有明显的表达变化,暗示这些基因可能参与油菜菌核病抗性功能.
文献关键词：
甘蓝型油菜;F-box-LRR基因家族;菌核病;基因表达
中图分类号：
作者姓名：
左蓉;吴姗;刘杰;胡鸣;程晓晖;刘越英;白泽涛;刘胜毅
作者机构：
中国农业科学院油料作物研究所,农业农村部油料作物生物学与遗传育种重点实验室,湖北武汉,430062
文献出处：
引用格式：
[1]左蓉;吴姗;刘杰;胡鸣;程晓晖;刘越英;白泽涛;刘胜毅-.油菜F-box-LRR基因全基因组鉴定与核盘菌诱导应答分析)[J].中国油料作物学报,2022(03):503-514
A类：
BnF,FBXLRR1,FBXLRR2,FBXLRR3,FBXLRR4
B类：
box,全基因组鉴定,核盘菌,应答分析,真菌性病害,抗病基因,抗病育种,抗逆,逆反应,结构域,植物抗病,防卫,生物信息学方法,甘蓝型油菜,组织表达,不同品种,中油,Westar,转录组数据,系统进化树,树上,亚类,保守序列,基因结构,拟南芥,同源基因,植物胁迫,胁迫响应,表达分析,家族基因,表达变化,暗示,油菜菌核病,菌核病抗性,性功能,基因家族
AB值：
0.280137
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