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大白菜LACS家族基因鉴定与表达分析
文献摘要:
长链脂酰辅酶A合成酶(LACS)能催化游离的脂肪酸形成酰基辅酶A,是脂肪酸激活、转运、氧化及储存脂合成等生化途径的关键酶,在许多生物过程中发挥重要作用.本研究利用生物信息学方法鉴定大白菜LACS家族基因成员,分析其亲缘关系、蛋白质理化性质、染色体定位、共线性关系、基因结构、蛋白保守结构域和基因表达模式.结果表明,从大白菜全基因组共鉴定到13个BrLACS基因成员,分成4组,不均匀地分布在7条染色体和1个Scaffold上.BrLACSs的蛋白长度和分子量分别为199~1072 aa和23.10~121.10 kDa.与拟南芥AtLACS1、AtLACS5和AtLACS6共线性的BrLACS基因发生了扩张,出现了双拷贝(BrLACS5a、BrLACS5b和BrLACS6a、BrLACS6b)及三拷贝(BrLACS1a、BrLACS1b和BrLACS1c).表达模式分析表明,BrLACS4和BrLACS8基因在大白菜不同器官/组织中表达量最高,尤其在控制花器官蜡质性状中起着重要作用,在有蜡粉大白菜中的表达量显著高于无蜡粉大白菜.本研究结果为解析大白菜LACS基因在控制大白菜蜡质性状中的分子机制和指导大白菜亮绿种质资源创新具有重要意义.
文献关键词:
大白菜;LACS家族;蜡质;生物信息学分析;基因表达
中图分类号:
作者姓名:
王荣花;王树彬;刘栓桃;张志刚;李巧云;王立华;赵智中
作者机构:
山东省农业科学院蔬菜研究所/国家蔬菜改良中心山东分中心/山东省设施蔬菜生物学重点实验室/农业部黄淮地区蔬菜科学观测实验站(山东),山东 济南 250100
文献出处:
引用格式:
[1]王荣花;王树彬;刘栓桃;张志刚;李巧云;王立华;赵智中-.大白菜LACS家族基因鉴定与表达分析)[J].山东农业科学,2022(06):1-9
A类:
BrLACS,BrLACSs,AtLACS1,AtLACS5,AtLACS6,BrLACS5a,BrLACS5b,BrLACS6a,BrLACS6b,BrLACS1a,BrLACS1b,BrLACS1c,BrLACS4,BrLACS8
B类:
大白菜,家族基因,基因鉴定,表达分析,长链,辅酶,合成酶,酰基,基辅,脂合成,关键酶,多生,生物过程,研究利用,利用生物,生物信息学方法,亲缘关系,染色体定位,共线性,基因结构,保守结构域,基因表达模式,全基因组,Scaffold,分子量,aa,kDa,拟南芥,拷贝,表达模式分析,不同器官,组织中表达,花器官,蜡质,蜡粉,亮绿,种质资源创新,生物信息学分析
AB值:
0.246695
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