典型文献
桃Q型C2H2锌指蛋白基因家族的鉴定及其在低温胁迫下的表达分析
文献摘要：
[目的]从桃基因组鉴定Q型C2H2锌指蛋白基因家族成员,并进行生物信息学与低温表达分析,为桃抗逆性研究提供理论依据.[方法]采用生物信息学方法分析桃46个Q型C2H2锌指蛋白家族成员的理化性质、系统进化和基因结构等,并利用实时荧光定量分析其低温胁迫下的表达特征.[结果]桃Q型C2H2锌指蛋白家族成员氨基酸数量介于155～607,且主要位于细胞核中.染色体定位揭示该家族成员不均匀地分布在8条染色体上.系统进化分析将桃和拟南芥的Q型C2H2基因聚为16个亚组.基因结构分析表明:同一亚族成员结构相似,外显子数量基本相同.顺式作用元件分析表明:大多数Q型C2H2锌指蛋白家族成员启动子序列上游2000 bp区域包含大量激素及非生物胁迫响应元件.qRT-PCR分析表明:低温胁迫下,桃Q型C2H2锌指蛋白家族成员中有16个成员为上调表达,且以PpC2H2-18基因最为显著.[结论]该家族成员均含有较高的保守基序和结构域,且可参与植物生长发育以及生物和非生物胁迫等,为桃的抗寒育种提供了参考.
文献关键词：
桃;Q型C2H2锌指蛋白;低温胁迫;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
郝兰兰;马乃膺;张仲兴;李小兰;王鸿
作者机构：
甘肃农业大学 园艺学院,甘肃 兰州 730070;甘肃省农业科学院 林果花卉研究所,甘肃 兰州 730070
文献出处：
引用格式：
[1]郝兰兰;马乃膺;张仲兴;李小兰;王鸿-.桃Q型C2H2锌指蛋白基因家族的鉴定及其在低温胁迫下的表达分析)[J].云南农业大学学报（自然科学）,2022(05):873-882
A类：
PpC2H2
B类：
基因家族,低温胁迫,表达分析,温表,抗逆性研究,生物信息学方法,锌指蛋白家族,基因结构,表达特征,细胞核,染色体定位,系统进化分析,拟南芥,结构相似,外显子,基本相同,顺式作用元件,启动子序列,列上,bp,非生物胁迫,胁迫响应,响应元,qRT,保守基序,结构域,植物生长发育,抗寒,育种
AB值：
0.223559
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