典型文献
PI3Kα抑制剂的虚拟筛选、分子动力学模拟及活性验证
文献摘要:
磷脂酰肌醇-3激酶信号通路的异常激活与肿瘤的发生与发展密切相关,被视为开发癌症治疗药物的关键靶点之一.本次实验采用基于靶点的虚拟筛选方法,根据Lipinski's规则和PAINS规则对ZINC15化合物数据库进行类药性筛选并从中过滤出来500万个化合物,使用分子对接软件Autodock-vina将这批化合物对接到PI3Kα 蛋白激酶(PDB ID:2RD0)的活性口袋中,通过聚类分析去除结构相似度高的化合物,应用ADMET-lab评价化合物的成药性,随后对精筛出来的化合物做进一步的体外活性测试.采用分子动力学模拟和MM-GBSA方法验证复合物体系的稳定性,最终获得4个潜在的PI3Kα靶向小分子抑制剂.化合物ZINC33127329的生物活性在微摩尔级别,其IC50值为8.79±2.58μmol/L.研究活性化合物与PI3Kα蛋白激酶的互作模式,揭示该化合物的构效关系,为设计选择性高,效力强的靶向PI3Kα蛋白激酶抑制剂提供了一定的理论指导与设计思路.
文献关键词:
磷脂酰肌醇-3激酶;抗肿瘤;虚拟筛选;分子对接;分子动力学模拟
中图分类号:
作者姓名:
殷智鑫;杨盛刚;张吉泉;汤磊;范菊娣
作者机构:
贵州医科大学药学院,贵州 贵阳 550025;贵州省化学合成药物研发利用工程技术研究中心,贵州 贵阳 550004
文献出处:
引用格式:
[1]殷智鑫;杨盛刚;张吉泉;汤磊;范菊娣-.PI3Kα抑制剂的虚拟筛选、分子动力学模拟及活性验证)[J].化学研究与应用,2022(12):2847-2856
A类:
PAINS,ZINC15,过滤出来,滤出来,2RD0,ZINC33127329
B类:
PI3K,虚拟筛选,分子动力学模拟,活性验证,磷脂酰肌醇,肿瘤的发生与发展,癌症治疗,治疗药物,关键靶点,筛选方法,Lipinski,类药性,万个,个化,分子对接,Autodock,vina,接到,PDB,ID,口袋,袋中,结构相似度,ADMET,lab,成药性,体外活性,MM,GBSA,方法验证,复合物,物体系,小分子抑制剂,摩尔,IC50,活性化合物,构效关系,蛋白激酶抑制剂
AB值:
0.352764
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