典型文献
2型糖尿病肝脏胰岛素抵抗差异基因分析
文献摘要：
目的 采用生物信息学的方法识别肝脏IR的关键基因,为改善2型糖尿病(T2DM)提供新思路.方法 从CTD数据库下载IR相关基因,同时从GEO数据库下载T2DM基因表达谱GSE15653,利用GEO2R在线工具筛选出T2DM的差异表达基因(DEGs),取2个数据集的交集基因为肝脏胰岛素抵抗基因(IR-DEGs).然后用R软件及STRING在线网站对IR-DEGs分别进行功能富集分析和蛋白质互作网络分析,并使用Cytoscape软件筛选关键基因.结果 筛选得到1197个IR-DEGs,其中在GSE15653中上调IR-DEGs 352个,下调IR-DEGs 845个.基因本体分析提示IR-DEGs主要富集于类固醇激素反应、Hsp90蛋白结合、热休克蛋白绑定、转录辅助激活、多肽结合等.通路分析提示,IR-DEGs主要富集于磷酸戊糖途径、ErbB信号通路、MAPK信号通路、胰岛素信号通路等.利用Cytoscape筛选出10个关键基因,分别是MAPK3、SRC、MAPK8、CCNB1、DLGAP5、ASPM、KRAS、NRAS、NUSAP1、BIRC5.结论 通过生物信息学分析可以发现肝脏胰岛素抵抗在2型糖尿病发展中起的新机制.
文献关键词：
肝脏;生物信息学分析;胰岛素抵抗;差异表达基因;GEO数据库
中图分类号：
作者姓名：
刘志红;孟令振;刘静;鲁明;王瑞英
作者机构：
050000 石家庄市,河北医科大学第二医院内分泌科;河北医科大学第四医院全科医学科;050000 石家庄市,河北医科大学第二医院医务处
文献出处：
引用格式：
[1]刘志红;孟令振;刘静;鲁明;王瑞英-.2型糖尿病肝脏胰岛素抵抗差异基因分析)[J].河北医药,2022(09):1302-1306
A类：
GSE15653
B类：
肝脏胰岛素抵抗,抗差,差异基因分析,方法识别,关键基因,T2DM,CTD,下载,基因表达谱,GEO2R,差异表达基因,DEGs,交集,STRING,线网,功能富集分析,蛋白质互作网络分析,Cytoscape,选关,选得,基因本体分析,类固醇激素,Hsp90,蛋白结合,热休克蛋白,绑定,多肽,通路分析,磷酸戊糖途径,ErbB,胰岛素信号通路,MAPK3,SRC,MAPK8,CCNB1,DLGAP5,ASPM,KRAS,NRAS,NUSAP1,BIRC5,生物信息学分析
AB值：
0.349988
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