典型文献
苦荞FtC4H基因克隆与生物信息学分析
文献摘要：
克隆苦荞苯丙烷类物质代谢途径中的关键酶肉桂酸-4-羟基化酶基因(FtC4H),为进一步研究其功能奠定基础.以云荞1号和小米荞为材料,提取不同发育期果壳RNA,利用RT-PCR法克隆苦荞FtC4H基因,运用生物信息学分析FtC4H蛋白的特征,构建FtC4H蛋白系统进化树,分析其基因表达.结果 表明,克隆的FtC4H基因序列包含1299bp完整的cDNA开放阅读框,编码432个氨基酸,为亲水性不稳定碱性蛋白,具有P450超家族保守域,不具有跨膜结构域,有丰富的二级结构,三级结构预测显示FtC4H与6vby.1.A的序列相似度高.系统进化分析结果表明,本研究克隆的FtC4H与已报道的苦荞其他C4H基因不同.qRT-PCR结果表明,FtC4H在小米荞的花和叶中相对表达量显著高于云荞1号.
文献关键词：
苦荞;RT-PCR克隆;肉桂酸-4-羟基化酶;生物信息学分析;实时荧光定量PCR
中图分类号：
作者姓名：
尹桂芳;段迎;杨晓琳;蔡苏云;王艳青;卢文洁;孙道旺;贺润丽;王莉花
作者机构：
云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业农村部西南作物基因资源与种质创制重点实验室,650205,云南昆明;山西中医药大学中药与食品工程学院,030619,山西太原
文献出处：
引用格式：
[1]尹桂芳;段迎;杨晓琳;蔡苏云;王艳青;卢文洁;孙道旺;贺润丽;王莉花-.苦荞FtC4H基因克隆与生物信息学分析)[J].作物杂志,2022(01):77-83
A类：
FtC4H,1299bp,6vby
B类：
苦荞,基因克隆,生物信息学分析,苯丙烷,类物质,物质代谢,代谢途径,关键酶,肉桂酸,羟基化,酶基因,小米,米荞,发育期,果壳,系统进化树,基因序列,cDNA,开放阅读框,亲水性,P450,超家族,跨膜结构域,二级结构,三级结构,结构预测,系统进化分析,qRT,相对表达量
AB值：
0.27147
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