典型文献
草鱼PepT2基因的克隆及其表达分析
文献摘要：
采用RT–PCR和cDNA末端快速扩增技术克隆草鱼(Ctenopharyngodon idellus)Ⅱ型小肽转运载体(PepT2)基因全长cDNA序列,对其进行生物信息学和共线性分析,并采用实时荧光定量PCR技术检测分析健康草鱼PepT2基因在不同组织中的表达情况.结果表明:草鱼PepT2基因的cDNA序列全长为2733 bp,包括开放阅读框2169 bp(编码722个氨基酸残基),5′非编码区82 bp和3′非编码区482 bp;草鱼PepT2基因结构含有20个外显子和19个内含子;预测蛋白相对分子质量为8.032×104,等电点为6.01,该蛋白具有与哺乳动物同源蛋白类似的12个螺旋跨膜结构,并且在跨膜区9和10之间有1个大的外环,跨膜区氨基酸高度保守,含有6个蛋白激酶C磷酸化位点和3个N–糖基化位点;预测的PepT2蛋白三级结构包含有18个α–螺旋和21个β–折叠;氨基酸序列同源性分析结果显示,草鱼PepT2氨基酸序列与斑马鱼(Danio rerio)的同源性最高,为86.65％,与其他所比较的物种的同源性则为52.83％～68.15％;系统进化树分析表明,草鱼与斑马鱼的亲缘关系最近;与斑马鱼相比,草鱼PepT2所在的染色体保留着大多数基因,具有保守的基因块;实时荧光定量表达分析表明,草鱼PepT2在肠道中的表达量最高,在肾脏中的表达量次之.
文献关键词：
草鱼;小肽转运载体;PepT2;克隆;生物信息学分析;共线性分析;组织表达
中图分类号：
作者姓名：
刘金梦;秦贝贝;黎航航;肖调义;苏建明
作者机构：
湖南省特色水产资源利用工程技术研究中心,湖南长沙 410128;湖南农业大学动物科学技术学院,湖南长沙 410128;湖南农业大学动物医学院,湖南长沙 410128
文献出处：
引用格式：
[1]刘金梦;秦贝贝;黎航航;肖调义;苏建明-.草鱼PepT2基因的克隆及其表达分析)[J].湖南农业大学学报（自然科学版）,2022(04):488-495
A类：
PepT2
B类：
草鱼,表达分析,cDNA,Ctenopharyngodon,idellus,小肽转运载体,全长,共线性分析,检测分析,不同组织,bp,开放阅读框,氨基酸残基,非编码区,基因结构,外显子,内含子,白相,相对分子质量,等电点,哺乳动物,同源蛋白,膜结构,蛋白激酶,磷酸化,糖基化位点,三级结构,折叠,氨基酸序列,序列同源性,同源性分析,斑马鱼,Danio,rerio,系统进化树分析,亲缘关系,定量表达,生物信息学分析,组织表达
AB值：
0.257015
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