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典型文献
节律基因NPAS2在肺腺癌中的临床意义
文献摘要:
目的:探究NPAS2基因在肺腺癌(LUAD)中的表达及其与相关临床参数的关联,分析其对患者总生存期(OS)的影响及在LUAD预后中的预测价值。方法:从癌症基因组图谱数据库(TCGA)中下载LUAD转录组测序及临床资料数据,分析LUAD肿瘤组织与正常肺组织中NPAS2的表达差异。收集LUAD患者肿瘤组织及正常肺组织应用蛋白免疫印迹法(WB)检测NPAS2蛋白表达,并分析TCGA数据库中NPAS2表达与LUAD患者肿瘤分期及OS的关联。通过基因集富集分析(GSEA)挖掘NPAS2潜在的致癌机制。结果:TCGA差异分析显示NPAS2 mRNA在LUAD肿瘤组织1.83(1.01,3.01)中的表达水平高于正常肺组织,0.74(0.49,1.15),差异有统计学意义( Z=7.21, P<0.05);配对分析显示NPAS2 mRNA在LUAD组织1.82(1.37,3.08)中的表达也高于配对的正常肺组织0.76(0.51,1.16),差异有统计学意义( Z=5.63, P<0.05)。WB结果显示,NPAS2蛋白在LUAD 0.62(0.40,1.36)中的表达水平高于正常肺组织0.14(0.08,0.58),差异有统计学意义( Z=2.71, P<0.05)。在亚组分析中,与T1~2组相比,T3~4组中NPAS2 mRNA高表达的比例更高1.81(1.01,2.92)比2.10(1.29,3.71)( Z=2.12, P<0.05);在预后分析中,NPAS2高表达组患者的预后相对较差,与NPAS2 mRNA低表达组比较差异有统计学意义( χ2=9.66, P<0.05),Kaplan-Meier plotter数据库显示NPAS2 mRNA高表达LUAD患者预后更差( HR=2.19, P<0.05),Cox比例风险模型进行多因素分析表明更高的TNM分期( HR=2.12, P<0.05)及NPAS2 mRNA高表达( HR=1.21, P<0.05)预后更差,与NPAS2低表达患者相比,NPAS2高表达患者OS更短( P<0.05);GSEA基因富集结果显示NPAS2高表达时,肿瘤、小细胞肺癌、细胞外基质受体相互作用、凋亡、白细胞跨内皮迁移、ERBB等通路相关基因显著富集。 结论:NPAS2在LUAD中高表达,并与肿瘤局部浸润和OS相关,可以作为LUAD独立的预后预测因子。
文献关键词:
肺腺癌;预后;NPAS2基因;基因集富集分析
作者姓名:
许敬平;袁关利;韩卓笑;康小红
作者机构:
新乡医学院第一附属医院肿瘤内科,新乡 453000;许敬平现在秦皇岛市第一医院全科医学科 066000;秦皇岛市第一医院呼吸与危重症医学科,秦皇岛 066000
文献出处:
引用格式:
[1]许敬平;袁关利;韩卓笑;康小红-.节律基因NPAS2在肺腺癌中的临床意义)[J].国际呼吸杂志,2022(23):1801-1808
A类:
B类:
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AB值:
0.232734
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