典型文献
基于生物信息学检测NSUN2基因在胶质瘤中的表达及临床意义
文献摘要:
目的 探究NSUN2基因在多形性胶质瘤(GBM)中的表达及临床意义.方法 从TCGA数据库下载正常脑组织和GBM组织测序数据及临床信息,采用R语言分析NSUN2基因的表达差异及其与临床病理特征的关系,利用单因素和多因素Cox回归模型分析GBM发生发展相关风险因素,CSEA软件分析NSUN2基因可能参与的信号通路,实时荧光定量PCR(qPCR)和免疫组织化学(IHC)对胶质瘤组织和癌旁组织进行mRNA和蛋白质表达水平验证分析.结果 GBM组织中NSUN2表达高于正常组织,差异有统计学意义(P<0.05);不同年龄、WHO分级、应答深度及IDH分型的GBM组织中NSUN2表达比较,差异有统计学意义(P<0.05);单因素和多因素Cox回归分析显示,NSUN2基因可作为GBM的独立预后因素.CSEA结果显示,NSUN2高表达与肿瘤相关通路相关;qPCR和IHC实验显示,与癌旁组织相比,胶质瘤组织中NSUN2基因的mRNA和蛋白质表达水平更高,差异有统计学意义(P<0.05).结论 GBM组织中NSUN2基因高表达且和病理特征相关,可能通过参与蛋白质相关的代谢促进GBM的发展,可作为GBM的预后标志物.
文献关键词:
胶质瘤;NSUN2;癌症基因组图谱;肿瘤标志物
中图分类号:
作者姓名:
张群;田秋思;唐铖铖;冯光;路宏朝
作者机构:
陕西理工大学生物科学与工程学院,陕西汉中723000;三二○一 医院神经外科,陕西汉中723000
文献出处:
引用格式:
[1]张群;田秋思;唐铖铖;冯光;路宏朝-.基于生物信息学检测NSUN2基因在胶质瘤中的表达及临床意义)[J].医学信息,2022(04):1-5
A类:
多形性胶质瘤
B类:
NSUN2,GBM,TCGA,下载,脑组织,序数,临床信息,语言分析,表达差异,临床病理特征,Cox,相关风险,CSEA,qPCR,免疫组织化学,IHC,癌旁组织,蛋白质表达水平,验证分析,正常组织,WHO,IDH,表达比较,独立预后因素,肿瘤相关,相关通路,预后标志物,癌症基因组图谱,肿瘤标志物
AB值:
0.223683
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