典型文献
P4HA3基因与结直肠癌进展及不良预后的相关性研究
文献摘要：
目的 探究脯氨酰4-羟化酶α-3(P4HA3)基因在结直肠癌(CRC)的表达及与不良预后的关系.方法 从The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库获取CRC基因数据,包含647例CRC患者肿瘤组织和51例癌旁组织.利用R软件对P4HA3表达及配对数据可视化分析.卡方检验分析P4HA3表达与CRC患者临床特征关系.利用R软件survival包对P4HA3进行生存分析.利用基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库验证TCGA数据库CRC中P4HA3的表达.通过基因集富集分析(GSEA)对P4HA3进行京都基因与基因组百科全科(KEGG)通路富集分析.采用免疫组化染色检测30例CRC患者手术切除的肿瘤和癌旁组织蜡块样本中的P4HA3蛋白表达.结果 R软件分析显示,与癌旁组织比较,P4HA3在CRC组织高表达(P<0.01).卡方检验显示,P4HA3表达与CRC患者Stage、T和N分期密切相关(P<0.05).生存分析显示,与低表达P4HA3患者比较,P4HA3高表达CRC患者的生存时间明显缩短(P<0.05).通过GEPIA数据库分析验证了P4HA3基因与CRC不良预后相关(P<0.05).进一步GSEA通路富集分析结果显示,P4HA3基因富集到的信号通路与多种恶性肿瘤的发生发展有关(FDR<0.05).最后,免疫组化检测验证了P4HA3蛋白在CRC组织中高表达.结论 基因P4HA3与CRC的进展及不良预后相关,P4HA3有望成为CRC患者新的治疗靶点.
文献关键词：
结直肠癌;P4HA3;生物信息学分析;预后分析;免疫组化
中图分类号：
作者姓名：
方帅帅;袁马驰
作者机构：
杭州市第三人民医院病理科 杭州 310009
文献出处：
引用格式：
[1]方帅帅;袁马驰-.P4HA3基因与结直肠癌进展及不良预后的相关性研究)[J].浙江中西医结合杂志,2022(06):515-519
A类：
P4HA3
B类：
结直肠癌,不良预后,脯氨,羟化酶,CRC,Cancer,Genome,Atlas,TCGA,基因数据,肿瘤组织,癌旁组织,数据可视化分析,卡方检验,检验分析,特征关系,survival,生存分析,基因表达谱,交互分析,GEPIA,基因集富集分析,GSEA,京都,百科,全科,通路富集分析,免疫组化染色,手术切除,Stage,低表达,生存时间,数据库分析,分析验证,基因富集,多种恶性肿瘤,FDR,免疫组化检测,测验,治疗靶点,生物信息学分析,预后分析
AB值：
0.24438
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