典型文献
基于TCGA数据库的肺腺癌自噬基因预后模型建立与应用
文献摘要:
目的 利用TCGA数据库建立预测肺腺癌(LUAD)预后的自噬基因(ATG)预后模型.方法 通过R(v3.6.1)软件筛选出TCGA数据库中LUAD样本及癌旁样本中差异表达的ATGs,探讨其潜在功能.进一步筛选预后相关的ATGs,计算各样本的风险值(RS)并构建预后模型,探讨RS与生存、临床特征之间的关系.结果 共筛选出9个生存相关ATGs(RAC1、SQSTM1、CD46、NRG3、IKBKB、VMP1、WIPI1、FKBP1B、IKBKB).RS是LUAD患者的独立预后因素(P<0.05),高RS与较短的生存期相关(P<0.05).结论 9个自噬基因构建的自噬预后风险模型,可以用来预测LUAD患者预后情况.
文献关键词:
肺腺癌;自噬基因;TCGA数据库;预后
中图分类号:
作者姓名:
陈彬彬;叶威;黄约诺;方涛;林雪娇;董晓亭
作者机构:
浙江中医药大学附属温州市中医院呼吸与危重症医学科 温州 325700
文献出处:
引用格式:
[1]陈彬彬;叶威;黄约诺;方涛;林雪娇;董晓亭-.基于TCGA数据库的肺腺癌自噬基因预后模型建立与应用)[J].浙江中西医结合杂志,2022(04):311-316
A类:
NRG3,VMP1
B类:
TCGA,肺腺癌,自噬基因,预后模型,建立与应用,数据库建立,LUAD,v3,癌旁,差异表达,ATGs,风险值,RS,RAC1,SQSTM1,CD46,IKBKB,WIPI1,FKBP1B,独立预后因素,生存期,预后风险模型,预后情况
AB值:
0.364689
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