典型文献
基于基因表达谱的银屑病自噬相关关键基因筛选和候选药物预测
文献摘要：
目的 利用生物信息学方法探究银屑病自噬相关关键基因(Hub)和潜在治疗药物.方法 通过基因表达谱数据集筛选差异表达基因(DEGs),收集自噬相关基因(ARGs)并与DEGs取交集得到自噬相关DEGs(DEARGs),构建蛋白质-蛋白质作用网络(PPI)进行基因本体功能注释,京都基因与基因组百科全书通路富集分析,应用分子复杂检测(MCODE)算法插件筛选显著的功能模块及Hub,并经独立数据集验证,然后运用DGIdb数据库预测潜在治疗药物.结果 筛选得到39个DEARGs,DEARGs在白细胞介素-17(IL-17)调节、炎性反应调控、自噬等方面显著富集,DEARGs主要参与腺苷酸活化蛋白激酶、脂肪细胞因子、核苷酸寡聚化结构域样受体、胰岛素抵抗等通路.PPI鉴定出6个Hub,即血管紧张素Ⅱ受体1、过氧化物酶体增生激活受体γ、瘦素、脂联素、烟酰胺磷酸核糖转移酶和IL-6,受试者工作特征曲线和数据集表达分析证实了6个中枢基因与银屑病的相关性.预测了包括环孢素、阿达木单抗、利妥昔单抗、异环磷酰胺在内的77种已批准药物可作为银屑病的潜在治疗药物.结论 采用生物信息学方法鉴定Hub预测潜在治疗药物有助于了解银屑病的分子机制,为其诊治提供新的见解.
文献关键词：
银屑病;自噬;自噬相关关键基因;信号通路;潜在治疗药物
中图分类号：
作者姓名：
郭宜城;罗美兰;许时贵;李小兰;付志媛
作者机构：
江西省皮肤病专科医院药剂科,南昌 330001;江西省皮肤病临床医学研究中心,南昌 330001
文献出处：
引用格式：
[1]郭宜城;罗美兰;许时贵;李小兰;付志媛-.基于基因表达谱的银屑病自噬相关关键基因筛选和候选药物预测)[J].重庆医学,2022(24):4263-4269,4280
A类：
自噬相关关键基因,DEARGs
B类：
基因表达谱,银屑病,关键基因筛选,候选药物,药物预测,利用生物,生物信息学方法,方法探究,Hub,潜在治疗药物,谱数据,差异表达基因,DEGs,自噬相关基因,交集,PPI,基因本体功能注释,京都基因与基因组百科全书通路富集,通路富集分析,MCODE,插件,功能模块,独立数,数据集验证,DGIdb,选得,炎性反应,反应调控,腺苷酸活化蛋白激酶,脂肪细胞因子,寡聚化,结构域,样受体,胰岛素抵抗,血管紧张素,过氧化物酶体,激活受体,瘦素,脂联素,烟酰胺磷酸核糖转移酶,受试者工作特征曲线,表达分析,中枢基因,环孢素,阿达木单抗,利妥昔单抗,异环磷酰胺
AB值：
0.282825
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
