典型文献
基于生物信息学的非小细胞肺癌相关基因筛选
文献摘要：
目的:利用生物信息学方法分析非小细胞肺癌(NSCLC)基因表达谱芯片,筛选相关差异基因,寻找NSCLC潜在的生物标志物.方法:从GEO数据库下载NSCLC相关芯片数据(GSE1987、GSE44077)及TCGA数据库中NSCLC数据,利用Funrich软件对差异基因进行相关功能及通路富集分析,并用STRING数据库对蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析,筛选出核心基因.然后,使用在线工具对核心基因进行组织表达、细胞表达及预后分析.结果:共筛选出7个共同上调表达的基因分别是:重组人分泌型磷蛋白1(SPP1)、SPINK1、母体胚胎亮氨酸拉链激酶(MELK)、谷胱甘肽过氧化酶2(GPX2)、CYP24A1、TFAP2、ETV4,主要参与血管内皮生长因子(VEGF)、PI3K、mTOR、ErbB受体、TNF、信号转导、凋亡等信号通路,主要参与细胞凋亡、蛋白质代谢、信号转导、细胞生长等生物学过程.MELK在肺组织及肺癌细胞系中相对高表达,Kaplan-Meier Plotter分析提示其是NSCLC预后的危险因素.结论:MELK可能成为NSCLC预后的潜在生物标志物,对其生物学作用的进一步研究有利于揭示NSCLC的具体发病机制以及提供新的潜在治疗靶点.
文献关键词：
生物信息学;非小细胞肺癌;基因筛选
中图分类号：
作者姓名：
史广林;缪雨青;钱佳燕;冒昕欣;施伟荣
作者机构：
南通市第六人民医院呼吸内科,江苏 南通 226011;南通市第六人民医院胸外科,江苏 南通 226011
文献出处：
引用格式：
[1]史广林;缪雨青;钱佳燕;冒昕欣;施伟荣-.基于生物信息学的非小细胞肺癌相关基因筛选)[J].吉林医学,2022(11):2885-2888
A类：
GSE1987,GSE44077,Funrich,母体胚胎亮氨酸拉链激酶,TFAP2
B类：
非小细胞肺癌,基因筛选,利用生物,生物信息学方法,NSCLC,基因表达谱芯片,选相,差异基因,GEO,下载,TCGA,相关功能,通路富集分析,STRING,蛋白质相互作用,PPI,核心基因,组织表达,预后分析,同上,组人,磷蛋白,SPP1,SPINK1,MELK,谷胱甘肽过氧化酶,GPX2,CYP24A1,ETV4,血管内皮生长因子,VEGF,PI3K,mTOR,ErbB,信号转导,蛋白质代谢,细胞生长,生物学过程,肺组织,肺癌细胞,细胞系,Kaplan,Meier,Plotter,潜在生物标志物,生物学作用,潜在治疗,治疗靶点
AB值：
0.332649
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