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典型文献
鳜plin2生物信息学分析、组织表达及其在肝脏脂肪蓄积中的作用
文献摘要:
为探究鱼类脂滴包被蛋白plin2(Perilipin 2)基因的结构和功能,研究成功地克隆并鉴定出鳜(Sinipercachuatsi)plin2的2个亚型,分别命名为plin2a和plin2b.氨基酸多重比对发现其编码序列与刺鱼(Gasterosteus aculeatus)具有高度的同源性.结构域分析发现鳜plin2a和plin2b具有与哺乳动物相似的N末端PAT结构域和11-mer重复结构域.基因共线性分析发现plin2两个亚型在鳜和刺鱼中高度保守.系统发育分析表明鳜plin2和刺鱼、攀鲈(Anabas testudineus)和半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)近源.RT-qPCR检测了plin2a与plin2b基因在鳜不同组织中的表达分布情况,结果表明鳜plin2a在肝脏中表达最高,其次是脂肪和脾脏组织;相反,plin2b基因在鳜的肝脏中几乎不表达,主要在肾脏、胃、脂肪和脑组织表达.此外,还探究了鳜肝脏和肝细胞在脂肪蓄积状态下plin2a基因的转录水平变化.实验结果表明在过量添加碳水化合物饲喂(8周)后,鳜肝脏中plin2a基因mRNA水平明显升高,鳜肝脏细胞在0.1 mmol/L棕榈酸钠刺激后显著增加了plin2a的mRNA水平.研究表明,鳜plin2两个亚型可能出现功能分化,并且plin2a作为肝脏脂代谢中的重要调节因子,可能在鳜肝脏脂肪蓄积中发挥更重要的功能.
文献关键词:
plin2;脂类代谢;生物信息学;组织表达;肝脏;鳜
作者姓名:
高俊杰;梁旭方;蔡文静;庄武元
作者机构:
华中农业大学水产学院, 华中农业大学鳜鱼研究中心, 武汉 430070;农业农村部淡水生物繁育重点实验室/农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室, 武汉 430070
文献出处:
引用格式:
[1]高俊杰;梁旭方;蔡文静;庄武元-.鳜plin2生物信息学分析、组织表达及其在肝脏脂肪蓄积中的作用)[J].水生生物学报,2022(03):273-281
A类:
plin2,Sinipercachuatsi,plin2a,plin2b,Gasterosteus,Anabas,testudineus
B类:
生物信息学分析,组织表达,肝脏脂肪蓄积,鱼类,类脂,脂滴,包被,Perilipin,结构和功能,编码序列,aculeatus,同源性,结构域,哺乳动物,PAT,mer,共线性分析,系统发育分析,攀鲈,半滑舌鳎,Cynoglossus,semilaevis,qPCR,不同组织,表达分布,脾脏,脑组织,肝细胞,转录水平,水平变化,碳水化合物,饲喂,肝脏细胞,棕榈酸钠,肝脏脂代谢,调节因子,脂类代谢
AB值:
0.276199
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