典型文献
昆明犬IGF2基因克隆、生物信息学分析及其时空表达研究
文献摘要:
[目的]克隆昆明犬胰岛素样生长因子2(IGF2)基因并研究其序列特征及时空表达规律,为工作犬体型及生长发育相关研究提供基础资料.[方法]采用PCR法扩增昆明犬IGF2基因CDS区,运用生物信息学分析预测昆明犬IGF2蛋白的结构与功能;利用实时荧光定量PCR技术检测IGF2基因在2.5月龄昆明犬心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏及大腿内侧肌肉和不同年龄段肝脏中的表达情况.[结果]昆明犬IGF2基因CDS区全长717 bp,编码238个氨基酸;系统进化树分析显示,昆明犬IGF2基因与赤狐的遗传距离最近,与鸡的遗传距离最远.生物信息学分析表明,IGF2蛋白分子质量为26.46 ku,理论等电点为9.61,无信号肽和跨膜结构,属于亲水性非分泌蛋白;主要分布于细胞核(47.8%)和线粒体(17.4%),存在23个磷酸化位点;该蛋白的二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,三级结构与二级结构预测结果相符.组织表达谱分析显示,IGF2基因在2.5月龄昆明犬肝脏中相对表达量最高,且极显著高于肾脏、肺脏及肌肉组织(P<0.01);仔犬期(2.5月龄)肝脏中的IGF2基因的表达量极显著高于幼犬期(6月龄)、青年期(1岁)及成年期(1.7和2.5岁)(P<0.01).[结论]本研究成功克隆昆明犬IGF2基因,并发现IGF2在多个组织广泛表达,在肝脏中的表达量最高,可为深入探讨昆明犬IGF2基因在生长发育中的调控机理提供参考.
文献关键词:
胰岛素样生长因子2(IGF2);昆明犬;克隆;序列分析;组织表达
中图分类号:
作者姓名:
韦云芳;李飞翔;星云;黄庆国;李居东;万九生;陈方良
作者机构:
公安部昆明警犬基地,昆明650204;警犬技术公安部重点实验室,昆明650204;云南农业大学动物科学技术学院,昆明650201
文献出处:
引用格式:
[1]韦云芳;李飞翔;星云;黄庆国;李居东;万九生;陈方良-.昆明犬IGF2基因克隆、生物信息学分析及其时空表达研究)[J].中国畜牧兽医,2022(03):866-875
A类:
B类:
昆明犬,IGF2,基因克隆,生物信息学分析,表达研究,胰岛素样生长因子,序列特征,时空表达规律,工作犬,体型,基础资料,CDS,分析预测,结构与功能,月龄,脾脏,肺脏,大腿,不同年龄段,全长,bp,系统进化树分析,赤狐,遗传距离,最远,分子质量,ku,等电点,信号肽,膜结构,亲水性,非分,分泌蛋白,细胞核,磷酸化,二级结构,无规则,卷曲,三级结构,结构预测,组织表达谱,表达谱分析,相对表达量,肌肉组织,幼犬,青年期,成年期,调控机理,序列分析
AB值:
0.299666
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