典型文献
静原鸡let-7a-5p的靶基因预测及组织表达分析
文献摘要：
[目的]了解let-7a-5p的生物学信息,初步探索其在静原鸡肌肉组织中的功能作用.[方法]利用生物信息学方法对转录组测序获得的静原鸡let-7a-5p的成熟序列进行保守性分析,使用miRDB、TargetScan和miRanda在线软件预测let-7a-5p的靶基因,取其交集进行GO功能和KEGG通路富集分析,并利用实时荧光定量PCR检测let-7a-5p在静原鸡公鸡和母鸡各组织中的表达水平.[结果]let-7a-5p的成熟序列在各物种间高度保守,共预测得到38个基因集合.在生物过程、细胞组分和分子功能中靶基因富集较多的GO条目有细胞过程、生物调节、细胞、结合和催化活性;靶基因显著富集于聚酮糖单元生物合成、AGE-RAGE信号通路在糖尿病并发症中的作用、泛素介导的蛋白水解、TGF-β信号通路和加压素调节的水重吸收信号通路,且富集最多的是代谢途径、AGE-RAGE信号通路在糖尿病并发症中的作用、泛素介导的蛋白水解和MAPK信号通路.let-7a-5p-靶基因互作主要通过作用于靶mRNA的3'-UTR抑制表达或使其降解.组织表达发现,let-7a-5p在静原鸡公、母鸡的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胸肌和腿肌组织中均有表达,且在胸肌和腿肌中表达量均较高.[结论]let-7a-5p可能靶向调节靶基因的表达,从而参与静原鸡肌肉生长发育,为进一步探究let-7a-5p的功能和作用机制提供理论依据.
文献关键词：
静原鸡;let-7a-5p;靶基因;生物信息学;组织表达谱
中图分类号：
作者姓名：
邓占钊;禹保军;曹国伟;张娟;石永宏;胡伟龙;仇秀玲
作者机构：
彭阳县畜牧技术推广服务中心,固原756599;宁夏大学农学院,银川750021;宁夏九三零生态农牧有限公司,银川750021
文献出处：
引用格式：
[1]邓占钊;禹保军;曹国伟;张娟;石永宏;胡伟龙;仇秀玲-.静原鸡let-7a-5p的靶基因预测及组织表达分析)[J].中国畜牧兽医,2022(10):3704-3712
A类：
B类：
静原鸡,let,7a,5p,靶基因预测,组织表达分析,初步探索,肌肉组织,功能作用,利用生物,生物信息学方法,转录组测序,保守性,miRDB,TargetScan,miRanda,软件预测,交集,通路富集分析,鸡公,公鸡,母鸡,种间,生物过程,中靶,基因富集,条目,催化活性,聚酮,生物合成,RAGE,糖尿病并发症,泛素,蛋白水解,TGF,加压素,重吸收,收信,代谢途径,MAPK,基因互作,UTR,制表,脾脏,肺脏,胸肌,腿肌,肌组织,靶向调节,肌肉生长发育,组织表达谱
AB值：
0.31797
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