克隆尼罗罗非鱼E-钙黏着蛋白(On-ECdh)基因,分析On-ECdh基因生物信息学特征及其在正常和无乳链球菌刺激后的尼罗罗非鱼组织中的表达情况.设计基因特异引物扩增On-ECdh基因片段,采用生物信息学对其序列进行分析,利用荧光定量PCR技术检测On-ECdh基因的表达模式.On-ECdh基因开放阅读框为2442 bp,编码813个氨基酸.On-ECdh理论分子质量为89.9 ku,等电点为4.81.On-ECdh基因推导氨基酸含有1个钙黏着蛋白前结构域、4个钙黏着蛋白重复样结构域、1个钙黏着蛋白细胞质结构域和1个跨膜结构域.On-ECdh与伯氏朴丽鱼E-钙黏着蛋白的氨基酸序列相似性最高,达79.04％,与其他鱼类、哺乳动物的相似性分别为42.44％～52.59％和37.12％～44.62％.荧光定量PCR分析表明,On-ECdh基因在健康的尼罗罗非鱼各组织中均有分布,在肝组织中的相对表达量最高,其次为鳃、肠道、胃、眼、肌肉、脾脏、脑、心脏、头肾.经无乳链球菌刺激后,On-ECdh基因相对表达量在头肾、眼和肠道中显著上调,而在胃、鳃和肝脏中呈下调趋势.眼、头肾和肠道中相对表达量分别在刺激1、3、12 h后达到最高峰,并在高峰后呈现回落趋势.胃、肝脏和鳃中的相对表达量分别在1、3、24 h时最低,胃和鳃中的相对表达量随时间呈现波浪型变化,肝脏中的则持续降低.试验结果表明,无乳链球菌可诱导On-ECdh基因表达,表明E-钙黏着蛋白可能在尼罗罗非鱼感染无乳链球菌时发挥一定的防御作用.

E-钙黏着蛋白;尼罗罗非鱼;基因克隆;序列分析;表达模式

杨惠源;陈泓霖;李瑞雪;杨志会;吴颖瑞;吴信忠;蔡小辉

北部湾大学 海洋学院,广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室,广西 钦州 536011;广西大学 生命科学与技术学院,广西 南宁 530004;邢台市农业农村局,河北 邢台 054000

水产科学

[1]杨惠源;陈泓霖;李瑞雪;杨志会;吴颖瑞;吴信忠;蔡小辉-.尼罗罗非鱼E-钙黏着蛋白的基因克隆及组织表达分析)[J].水产科学,2022(03):370-378

ECdh

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