[目的]分析大白猪溶质载体30A(ZnT)基因家族成员的生物学特性,并检测其在猪不同组织中的表达水平,为研究ZnT基因家族调控锌的代谢提供科学依据.[方法]使用多种生物信息学软件对猪ZnT基因家族10个成员(ZnT1～ZnT10)进行序列分析,包括基序、保守结构域、跨膜结构域、进化树、蛋白相互作用分析;使用实时荧光定量PCR方法检测ZnT基因家族在6月龄大白猪心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、卵巢、乳腺中的表达差异.[结果]ZnT1～ZnT10基因定位到猪的8条染色体上,分子质量在41.61～85.30 ku之间;等电点介于6.27～9.30之间,其中ZnT6等电点最高为9.30,ZnT1等电点最低为6.27.ZnT基因家族中,除ZnT3外都属于稳定蛋白,除ZnT5、ZnT9外都含有6层跨膜结构域,除ZnT6、ZnT9外所含基序顺序均一致,Cation-efflux是ZnT基因家族共有的保守结构域.ZnT6与ZnT2、ZnT3、ZnT7、ZnT9蛋白关联程度最高,ZnT1与ZnT3蛋白关联程度最高,ZnT8与其他家族成员间关系较远.ZnT基因家族序列在哺乳动物进化过程中相对保守.ZnT基因家族的10个基因在大白猪肺脏中相对表达量较高,在心脏中相对表达量较低,除ZnT5、ZnT7、ZnT9外的ZnT基因家族的其他成员在肌肉中几乎不表达.[结论]ZnT家族属于跨膜结构蛋白,所含基序顺序基本一致,Cation-efflux是ZnT基因家族共有的保守结构域.ZnT基因家族多数成员在大白猪肺脏中表达量最高,在心脏和肌肉中相对表达量较低.

大白猪;ZnT基因家族;生物信息学分析;组织表达

李月月;吕冬玲;刘笑笑;田威龙;梁靓;陈奎蓉;程锋;兰干球;梁晶

广西大学动物科学技术学院,南宁530004

中国畜牧兽医

[1]李月月;吕冬玲;刘笑笑;田威龙;梁靓;陈奎蓉;程锋;兰干球;梁晶-.大白猪ZnT基因家族生物信息学分析及组织表达研究)[J].中国畜牧兽医,2022(11):4119-4128

ZnT,ZnT1,ZnT10,ZnT6,ZnT3,ZnT5,ZnT9,ZnT2,ZnT7

大白猪,基因家族,生物信息学分析,组织表达,表达研究,溶质载体,30A,生物学特性,不同组织,生物信息学软件,序列分析,基序,保守结构域,跨膜结构域,进化树,蛋白相互作用,相互作用分析,月龄,猪心,脾脏,肺脏,表达差异,基因定位,分子质量,ku,等电点,所含,均一,Cation,efflux,关联程度,ZnT8,他家,较远,哺乳动物,相对表达量,族属,结构蛋白,数成

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