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粗毛淫羊藿叶绿体基因组及其结构分析
文献摘要：
本研究通过Illumina HiSeq X-Ten高通量测序平台对粗毛淫羊藿的叶绿体基因组进行测序,并应用生物信息学分析工具对其结构特征进行比较分析.结果表明,粗毛淫羊藿叶绿体基因组大小为156894 bp,具有被子植物典型的环状四分体结构,大单拷贝区(large single copy,LSC)长度为88496 bp,小单拷贝区(small single copy,SSC)长度为16685 bp,2个反向重复区(inverted repeat sequence,IRa/IRb)长度为25809 bp;粗毛淫羊藿叶绿体基因组有133个基因,其中包括85个蛋白编码基因、10个rRNA基因和38个tRNA基因,44个外显子,23个内含子.研究结果丰富了淫羊藿属物种的叶绿体基因组资料,可为淫羊藿属物种的分子标记开发、系统学研究与药材的混伪品鉴定提供参考.
文献关键词：
粗毛淫羊藿;叶绿体基因组;高通量测序;结构分析;鉴定
中图分类号：
作者姓名：
严福林;任得强;魏升华;何顺志
作者机构：
贵州中医药大学,贵阳 550025
文献出处：
引用格式：
[1]严福林;任得强;魏升华;何顺志-.粗毛淫羊藿叶绿体基因组及其结构分析)[J].种子,2022(11):47-53
A类：
粗毛淫羊藿
B类：
叶绿体基因组,Illumina,HiSeq,Ten,高通量测序平台,生物信息学分析,基因组大小,bp,被子植物,环状四分体,分体结构,拷贝,large,single,copy,LSC,small,SSC,重复区,inverted,repeat,sequence,IRa,IRb,蛋白编码,编码基因,rRNA,tRNA,外显子,内含子,分子标记开发,系统学,混伪品,伪品鉴定
AB值：
0.325785
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