典型文献
楸树CbuATX1,CbuATX1-like和CbuATX2基因克隆及生物信息学分析
文献摘要：
开花是高等植物内部遗传因素和外界环境因素共同调节完成的复杂生命过程,是植物进入生殖生长从而具备遗传能力和繁殖能力的象征.使用PCR技术,以楸树(Catalpa bungei)混合芽cDNA为模板分别克隆CbuATX1,CbuATX1-like和CbuATX23个基因,并利用相关生物信息学软件对这3个基因编码的蛋白质结构进行预测,同时对基因的启动子序列进行顺式作用元件分析,通过qRT-PCR技术检测3个基因在楸树混合芽不同发育时期的表达量.结果 表明:CbuATX1的CDS全长为726 bp,编码241个氨基酸,存在跨膜运输结构,属于HMA蛋白家族,与芝麻(Sesamum indicum)、甜菜(Beta vulgaris)亲缘关系较近.CbuATX1-like的CDS全长为801 bp,编码266个氨基酸,存在跨膜运输结构,属于HMA蛋白家族,与胡萝卜(Daucus carota)、欧洲橄榄(Olea europaea)亲缘关系较近.CbuATX2的CDS全长为1554 bp,编码517个氨基酸,不存在跨膜运输结构,属于PWWP蛋白家族,与马尾草(Erythranthe guttatus)亲缘关系较近.这3个基因启动子均含有多个真核生物启动子的基本元件,如CAAT-box和TATA-box等,此外,还含有光响应、低温响应、生长素响应,以及与干旱诱导相关的MYB结合位点等3个基因与光响应密切相关,还可能参与外界环境胁迫响应等过程.qRT-PCR结果显示,上述3个基因在1年生普通楸树无性系9-1和突变株系-百日花楸树不同发育时期的表达量呈现显著差异.通过以上研究以期能够进一步阐述百日花楸树开花的性状,为楸树开花机制的研究和楸树的定向遗传改良提供理论支持.
文献关键词：
楸树;CbuATX;克隆;开花;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
赵佳明;樊二勤;刘轶;王智;王军辉;曲冠证
作者机构：
东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室,哈尔滨150040;中国林业科学研究院林业研究所,林木遗传育种国家重点实验室,国家林业和草原局林木培育重点实验室,楸树国家创新联盟,北京100091;中国检验检疫科学研究院,北京100176
文献出处：
引用格式：
[1]赵佳明;樊二勤;刘轶;王智;王军辉;曲冠证-.楸树CbuATX1,CbuATX1-like和CbuATX2基因克隆及生物信息学分析)[J].植物研究,2022(01):47-61
A类：
CbuATX1,CbuATX2,CbuATX23,PWWP,Erythranthe,guttatus,CbuATX
B类：
like,基因克隆,生物信息学分析,开花,高等植物,遗传因素,外界环境,同调,生命过程,生殖生长,繁殖能力,Catalpa,bungei,混合芽,cDNA,别克,生物信息学软件,基因编码,蛋白质结构,启动子序列,顺式作用元件,qRT,不同发育时期,CDS,全长,bp,跨膜运输,运输结构,HMA,白家,芝麻,Sesamum,indicum,甜菜,Beta,vulgaris,亲缘关系,胡萝卜,Daucus,carota,橄榄,Olea,europaea,马尾,基因启动子,真核生物,本元,CAAT,box,TATA,光响应,低温响应,生长素,干旱诱导,MYB,结合位点,环境胁迫,胁迫响应,无性系,突变株,株系,百日,花楸树,遗传改良
AB值：
0.376597
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