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典型文献
非洲菊CAT2基因的克隆及表达
文献摘要:
为研究非洲菊过氧化氢酶(CAT)基因的序列特性及其在不同逆境处理下的表达水平,以'玲珑'非洲菊为材料,利用RT-PCR技术成功克隆获得了一个编码序列(CDS)长度为1479 bp的CAT基因,对该基因及其编码蛋白进行了生物信息学分析,同时利用qRT-PCR技术研究了其在不同组织器官和不同胁迫处理下的表达水平.结果显示,CAT基因可编码492个氨基酸、分子质量为56.854 ku、等电点为6.5、无信号肽和跨膜结构的稳定亲水蛋白.其编码蛋白定位于过氧化物酶体,含有典型的CAT保守结构域和血红素结合位点.序列比对结果显示,非洲菊CAT基因与刺苞菜蓟CAT2基因的相似度最高,达88.00%,故将其命名为GjCAT2.进化分析显示,该蛋白与莴苣等菊科植物CAT的亲缘关系最近.GjCAT2基因在非洲菊花茎中的相对表达量最高,分别为叶、叶柄和花蕾的31.82、7.48和10.75倍.在聚乙二醇(PEG)模拟干旱和低温胁迫下,GjCAT2基因的相对表达量均呈"升—降—升"的趋势,分别于处理4和8 h时达到最大值;接种隐地疫霉初期,GjCAT2基因的表达受到极显著抑制,但侵染6 d时的相对表达量骤升为CK的3.11倍.本研究结果表明:GjCAT2属于典型性CAT,可能在非洲菊抵御干旱、低温以及隐地疫霉侵染过程中发挥重要作用.
文献关键词:
非洲菊;过氧化氢酶;基因克隆;表达水平;逆境胁迫响应
作者姓名:
卢珍红;武欢;焦元辰;张永艳;李绅崇;杨春梅;程春振
作者机构:
云南省农业科学院花卉研究所,云南 昆明650100;玉溪云星生物科技有限公司,云南 玉溪652604;福建农林大学园艺学院,福建 福州350002;山西农业大学园艺学院,山西 晋中030801
引用格式:
[1]卢珍红;武欢;焦元辰;张永艳;李绅崇;杨春梅;程春振-.非洲菊CAT2基因的克隆及表达)[J].福建农林大学学报(自然科学版),2022(06):774-781
A类:
CAT2,GjCAT2
B类:
非洲菊,过氧化氢酶,序列特性,玲珑,编码序列,CDS,bp,编码蛋白,生物信息学分析,qRT,不同组织,组织器官,胁迫处理,可编,分子质量,ku,等电点,信号肽,膜结构,定亲,亲水,蛋白定位,过氧化物酶体,保守结构域,血红素,结合位点,序列比对,刺苞,进化分析,莴苣,菊科植物,亲缘关系,菊花,花茎,相对表达量,叶柄,花蕾,聚乙二醇,PEG,低温胁迫,典型性,侵染过程,基因克隆,逆境胁迫响应
AB值:
0.335588
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