典型文献
葡萄醛酮还原酶(AKR)基因家族的鉴定与表达分析
文献摘要:
为明确AKR基因在葡萄非生物胁迫中的作用,利用生物信息学方法对葡萄AKR基因家族(VvAKRs)进行了全基因组鉴定,并验证其在非生物胁迫下的表达规律.结果表明:(1)该基因家族在葡萄基因组中有9个成员,主要分布在5条染色体上;氨基酸残基在275~2686 aa之间,理论等电点在5.1~9.1之间.(2)系统进化分析表明,该基因家族分为6个亚族,第6亚族VvAKR家族成员最多.(3)密码子偏好性分析结果表明,葡萄AKR基因家族密码子偏好性较弱.(4)共线性分析表明,葡萄9个AKR基因中只有VvAKR8和VvAKR9之间存在共线性关系.(5)qRT-PCR分析结果显示,葡萄AKR家族基因在根、茎、叶不同组织中对激素和非生物胁迫的响应程度有差异.非生物胁迫下,VvAKR1、VvAKR3、VvAKR8和VvAKR9基因在葡萄根、茎、叶组织中表达量较高;激素处理下,根组织中VvAKR3、VvAKR6和VvAKR8基因在ABA、MeJA、SA处理下表达量较高;茎组织中VvAKR3基因在NAA、GA3处理下表达量较高;叶组织中VvAKR1基因在各激素处理下表达量都较高.研究认为,葡萄AKR基因家族在响应葡萄非生物胁迫时发挥着不同的作用,为葡萄抗逆性研究提供了一定的理论依据.
文献关键词:
葡萄;AKR基因家族;生物信息学分析;qRT-PCR
中图分类号:
作者姓名:
周雪婷;梁国平;卢世雄;郭丽丽;陈佰鸿;毛娟
作者机构:
甘肃农业大学园艺学院,兰州 730070
文献出处:
引用格式:
[1]周雪婷;梁国平;卢世雄;郭丽丽;陈佰鸿;毛娟-.葡萄醛酮还原酶(AKR)基因家族的鉴定与表达分析)[J].西北植物学报,2022(11):1851-1861
A类:
VvAKRs,VvAKR,VvAKR8,VvAKR9,VvAKR1,VvAKR3,VvAKR6
B类:
醛酮,还原酶,基因家族,表达分析,非生物胁迫,利用生物,生物信息学方法,全基因组鉴定,表达规律,氨基酸残基,aa,等电点,系统进化分析,密码子偏好性,偏好性分析,共线性分析,qRT,家族基因,不同组织,响应程度,组织中表达,激素处理,根组织,ABA,MeJA,SA,NAA,GA3,抗逆性研究,生物信息学分析
AB值:
0.199474
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