典型文献
葡萄MAPK基因家族鉴定及逆境胁迫下的表达分析
文献摘要：
探究葡萄MAPK家族成员的特性及潜在功能,为葡萄抗逆基因资源的挖掘和利用提供理论依据.本研究克隆获得葡萄MAPK基因家族成员并对其进行生物信息学分析,根据基因芯片数据分析各成员的组织表达特征,结合qRT-PCR明确其对非生物胁迫的响应情况.结果表明,葡萄中共获得43个MAPK成员,分别命名为VvMAPK1～VvMAPK43,分布于15条染色体上,其中有6个成员集中分布于18号染色体上,5个分布于5号染色体上.氨基酸大小为114～1 520 aa,VvMAPK15编码的氨基酸序列最长,为1 520个氨基酸残基,VvMAPK23编码的氨基酸序列最短,为114个.相对分子量集中为12.26～16.70 ku,等电点为4.94～10.01.芯片数据分析发现,经ABA处理后,VvMAPK5、VvMAPK7和VvAMAPK13的表达量明显下调,在盐、PEG和低温处理下,VvMAPK6、VvMAPK9和VvMAPK13的表达量明显上调;不同成员在不同组织以及同一组织的不同生长阶段表达水平差异显著.qRT-PCR分析发现,大多数VvMAPK家族成员受到200 mmol·L-1 NaCl的诱导,表达水平较对照上调显著,VvMAPK9、VvMAPK27、VvMAPK29和VvMAPK38 在 500 μmol·L-1 ABA、200 mmol·L-1 NaCl 和 10％PEG 处理后均上调表达显著,对 3 种非生物胁迫的响应强烈.研究结果表明,葡萄MAPK家族成员在不同非生物胁迫下存在不同的潜在功能,为葡萄基因改良和遗传育种提供理论基础.
文献关键词：
葡萄;MAPK;生物信息学分析;逆境胁迫;qRT-PCR
中图分类号：
作者姓名：
马宗桓;黄青勇;李艳梅;李文芳;毛娟;陈佰鸿
作者机构：
甘肃农业大学园艺学院,兰州 730070
文献出处：
引用格式：
[1]马宗桓;黄青勇;李艳梅;李文芳;毛娟;陈佰鸿-.葡萄MAPK基因家族鉴定及逆境胁迫下的表达分析)[J].西北农业学报,2022(08):969-980
A类：
VvMAPK1,VvMAPK43,VvMAPK15,VvMAPK23,VvMAPK5,VvMAPK7,VvAMAPK13,VvMAPK6,VvMAPK9,VvMAPK13,VvMAPK,VvMAPK27,VvMAPK29,VvMAPK38
B类：
基因家族鉴定,逆境胁迫,表达分析,抗逆,基因资源,生物信息学分析,基因芯片,组织表达,表达特征,qRT,非生物胁迫,共获,aa,氨基酸序列,氨基酸残基,相对分子量,ku,等电点,ABA,PEG,低温处理,不同组织,生长阶段,NaCl,照上,下存,遗传育种
AB值：
0.203699
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