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日本囊对虾核因子κB抑制蛋白激酶ε2基因克隆及表达
文献摘要：
[目的]了解核因子κB抑制蛋白激酶ε2(IKKε2)基因在日本囊对虾(Marsupenaeus japonicus)受细菌刺激后的应答情况,以阐释IKKε2在对虾先天免疫中所起的作用.[方法]从日本囊对虾转录组数据中获得日本囊对虾IKKε2(命名为PjIKKε2)的cDNA序列,并进行生物信息学分析,采用荧光定量PCR分析PjIKKε2的组织表达以及受哈维弧菌(Vibrio harveyi)刺激后在肝胰腺组织的表达情况.[结果]PjIKKε2全长为4009 bp,其中开放阅读框长2337 bp,编码778个氨基酸,5′UTR(Untranslated region)174 bp,3′UTR 1498 bp.PjIKKε蛋白含有一个激酶结构域、一个类泛素结构域和一个TANK结合激酶卷曲螺旋结构域.多重序列比对结果显示,PjIKKε2蛋白序列与其他甲壳类IKKε的相似性高,在激酶结构域保守性高.系统进化树结果显示,PjIKKε2与其他对虾属的IKKε聚集在一支.PjIKKε2在日本囊对虾9个组织中均有表达,在淋巴组织中表达量最高(P<0.05).在哈维弧菌刺激6 h后,PjIKKε2在肝胰腺中表达量显著上调,达到最大值(P<0.05).[结论]PjIKKε2参与了日本囊对虾的先天免疫.
文献关键词：
日本囊对虾;核因子κB抑制蛋白激酶ε2;基因表达;先天免疫
中图分类号：
作者姓名：
范嗣刚;刘勇;赵超;侯思禹;邱丽华
作者机构：
中国水产科学研究院南海水产研究所 / 广东省渔业生态环境重点实验室 / 农业农村部水产品加工重点实验室,广东 广州 510300;上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306;天津农学院水产学院,天津 300384
文献出处：
引用格式：
[1]范嗣刚;刘勇;赵超;侯思禹;邱丽华-.日本囊对虾核因子κB抑制蛋白激酶ε2基因克隆及表达)[J].广东海洋大学学报,2022(02):13-19
A类：
PjIKK
B类：
日本囊对虾,核因子,蛋白激酶,基因克隆,Marsupenaeus,japonicus,细菌刺激,先天免疫,转录组数据,cDNA,生物信息学分析,组织表达,哈维弧菌,Vibrio,harveyi,肝胰腺,胰腺组织,全长,bp,开放阅读框,UTR,Untranslated,region,酶结构,结构域,泛素,TANK,卷曲螺旋,螺旋结构,序列比对,甲壳类,保守性,系统进化树,淋巴组织,组织中表达
AB值：
0.283821
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