典型文献
老班瑶药牛耳风叶绿体基因组特征及其密码子使用偏好性分析
文献摘要：
为探究老班瑶药牛耳风叶绿体基因组的结构特征、系统进化以及密码子偏好性,以瑶药牛耳风为研究材料,对其叶绿体基因组进行测序和组装.结果表明,牛耳风叶绿体基因组由大单拷贝区、小单拷贝区以及1对反向重复区组成,全长189 920 bp,包含118个基因,其中99个编码蛋白质的基因,11个tRNA基因,8个核糖体rRNA基因;共检测到71个简单序列重复(simple sequence repeat,SSR)位点.系统进化分析表明牛耳风与番荔枝属的刺果番荔枝(Annona muricata)亲缘关系最近.密码子偏好性分析表明,牛耳风的密码子偏好性较弱,且密码子偏好性主要受选择因素的影响,最终选出11个最优密码子,其中10个以A/U结尾,为瑶药牛耳风的系统进化研究等提供科学依据.
文献关键词：
牛耳风;叶绿体基因组;特征;密码子偏好性
中图分类号：
作者姓名：
严其伟;梁湘兰;陶秋云;罗秋香;郭松
作者机构：
广西科技师范学院食品与生化工程学院,广西来宾546199;广西科技师范学院壮瑶药品质生物学重点实验室,广西来宾546199;金秀瑶族自治县国有金秀林场,广西来宾545799;金秀瑶族自治县瑶医医院,广西来宾545799
文献出处：
引用格式：
[1]严其伟;梁湘兰;陶秋云;罗秋香;郭松-.老班瑶药牛耳风叶绿体基因组特征及其密码子使用偏好性分析)[J].中国农业科技导报,2022(08):74-86
A类：
牛耳风
B类：
瑶药,风叶,叶绿体基因组,基因组特征,密码子使用偏好性,偏好性分析,密码子偏好性,拷贝,重复区,全长,bp,编码蛋白,tRNA,核糖体,rRNA,简单序列重复,simple,sequence,repeat,SSR,系统进化分析,番荔枝,Annona,muricata,亲缘关系,最优密码子,结尾
AB值：
0.184908
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