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泛基因组学在食源性致病菌检测及其耐药监测中的应用
文献摘要：
食源性致病菌引起的食源性疾病在全球范围内时有暴发,对致病菌的调查和监测是预防和控制疾病大范围发生的有效手段.然而菌株的遗传变异给监测工作带来了挑战,同时罕见的、未知的菌株信息用传统鉴定方法难以实现.泛基因组学作为新发展的基因组分析方法,提供了更完整的基因组信息,在分离株鉴别、菌株遗传差异研究等方面具有重要贡献.结合数据库与分析软件,泛基因组分析在揭示致病菌的毒力及耐药基因、寻找新的抑菌靶点、监测基因水平转移情况等方面具有很大的应用潜力.本文简要介绍了泛基因组概念和分析方法,综述了其在致病菌快速检测、风险溯源以及风险预警方面的应用,深入阐述了泛基因组分析在耐药性监测和防控领域的发展状况,以期为基于基因组层面的食源性致病菌风险评估提供参考.
文献关键词：
泛基因组学;食源性致病菌;致病性;抗生素耐药性;风险防控
中图分类号：
作者姓名：
黎梓怡;施春雷
作者机构：
上海交通大学农业与生物学院, 微生物代谢国家重点实验室, 上海 200240
文献出处：
引用格式：
[1]黎梓怡;施春雷-.泛基因组学在食源性致病菌检测及其耐药监测中的应用)[J].食品安全质量检测学报,2022(14):4472-4478
A类：
B类：
泛基因组学,食源性致病菌,致病菌检测,耐药监测,食源性疾病,预防和控制,遗传变异,监测工作,传统鉴定,鉴定方法,难以实现,基因组分析,基因组信息,分离株,遗传差异,差异研究,毒力,耐药基因,抑菌,基因水平转移,移情,快速检测,风险溯源,风险预警,警方,耐药性监测,致病性,抗生素耐药性
AB值：
0.269197
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