目的 通过高通量的肿瘤生物学信息数据库,分析Runt相关转录因子1(RUNX1)在胶质母细胞瘤(GBM)中的表达和预后关系,以及初步的分子机制.方法 检索GEO数据库,利用GEO2R工具分析GBM相关的三组基因芯片(GSE50161、GSE108476和GSE15824),筛选显著高表达的差异基因.运用TCGA数据库分析工具:GEPIA在线工具分析RUNX1和补体调节因子Ⅰ(CFⅠ)在GBM中的表达及和临床预后的关系,同时分析RUNX1与CFⅠ等基因表达的相关性.运用JASPAR转录因子数据库分析RUNX1与CFⅠ的转录调控关系.然后采用TISCH单细胞测序数据库分析RUNX1在肿瘤微环境中的表达情况.最后运用GeneMANIA数据库分析RUNX1的蛋白相互作用网络和可能参与调控的信号通路,并通过siRNA细胞干扰实验和增殖实验进行初步验证.结果 通过分析三组基因芯片发现RUNX1和CFⅠ在GBM中显著高表达,且GEPIA工具分析显示GBM组RUNX1和CFⅠ表达明显高于正常组,差异均有统计学意义(P<0.05).RUNXI和CFⅠ基因对肿瘤患者的生存预后有显著相关性(相关系数=0.6,P<0.05).转录因子数据分析发现RUNX1可能在转录水平调控CFⅠ的表达.单细胞数据库分析发现RUNX1在肿瘤细胞及免疫细胞中均异常高表达.蛋白质相互作用网络分析发现RUNX1被干扰后,Wnt通路的下游分子β-catenin及下游靶基因MYC和CD44的mRNA水平也明显下调,RUNX1下调明显抑制了肿瘤细胞的增殖.结论 RUNX1在GBM中高表达,且提示临床预后不良.初步的分子机制提示RUNX1可能通过转录调节CFⅠ的表达抑制免疫反应,同时通过激活Wnt/β-catenin信号促进肿瘤的发生、发展.

数据库分析;Runt相关转录因子1;补体调节因子Ⅰ;胶质母细胞瘤

陈亚伦;宋彦

南阳市第二人民医院神经内科,河南南阳 473012

现代医药卫生

[1]陈亚伦;宋彦-.基于生物信息学分析胶质母细胞瘤中RUNX1基因的表达及临床意义)[J].现代医药卫生,2022(13):2165-2171

GSE50161,GSE108476,GSE15824,RUNXI,单细胞数据库

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