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基于TCGA数据库胶质母细胞瘤患者预后铁死亡基因相关lncRNA预测模型构建
文献摘要：
目的 构建基于肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库胶质母细胞瘤(GBM)患者预后铁死亡基因相关lncRNA预测模型.方法 通过TCGA数据库获取GBM的高通量测序数据,通过文献检索和搜查FerrDb数据库两种方式获取铁死亡基因,并基于GBM中铁死亡相关差异表达的lncRNA构建GBM预后的多lncRNA模型,分析预后lncRNA与铁死亡基因的共表达关系.结果 共获得与GBM相关的铁死亡基因246个,铁死亡相关lncRNA 2624个,经差异分析和降维处理,最终得到102个与GBM显著相关的铁死亡基因,并构建了一个包含111个lncRNA的GBM预后模型,其中,69个差异有统计学意义的铁死亡基因与73个GBM预后相关的铁死亡lncRNA之间存在共表达关系.Kaplan-Meier生存曲线显示,在预后模型下,高危者和低危者的总生存率差异有统计学意义(P<0.01).结论 基于TCGA数据库成功构建GBM患者预后铁死亡基因相关lncRNA预测模型,该模型可在一定程度上预测GBM患者的生存率.
文献关键词：
胶质母细胞瘤;铁死亡;长链非编码RNA;生物信息学;TCGA
中图分类号：
作者姓名：
裴珍珍;王革生;宋光荣;蔡旭;杜勇;东潇博
作者机构：
北京中医药大学东方医院神经外科,北京100078
文献出处：
引用格式：
[1]裴珍珍;王革生;宋光荣;蔡旭;杜勇;东潇博-.基于TCGA数据库胶质母细胞瘤患者预后铁死亡基因相关lncRNA预测模型构建)[J].山东医药,2022(34):64-67
A类：
B类：
TCGA,胶质母细胞瘤,铁死亡,lncRNA,预测模型构建,肿瘤基因组图谱,GBM,序数,文献检索,搜查,FerrDb,两种方式,中铁,差异表达,共表达,表达关系,共获,降维处理,一个包,预后模型,Kaplan,Meier,生存曲线,高危者,总生存率,长链非编码
AB值：
0.249603
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