典型文献
基于癌症基因图谱数据库分析SNRPEP2在肝细胞癌中的表达及其临床意义
文献摘要:
目的 利用癌症基因图谱(TCGA)数据库探讨小核糖核蛋白多肽E假基因2(SNRPEP2)在肝细胞癌(HCC)中的表达及其临床意义.方法 从TCGA数据库下载374例HCC组织样本和50例癌旁组织样本的转录组测序数据和临床资料,采用生物信息学方法,分析SNRPEP2在HCC中的表达水平及其与临床病理特征和预后的关系,运用Cox回归分析影响患者预后的危险因素并构建Nomogram预测模型,通过绘制ROC曲线评估SNRPEP2在HCC诊断中的效能.结果 HCC组织中SNRPEP2表达水平明显高于癌旁正常组织(P<0.01).HCC中SNRPEP2高表达与肿瘤的组织学分级(OR=2.539,P<0.01)、血清甲胎蛋白水平(OR=2.966,P<0.01)、血管浸润(OR=1.658,P<0.05)和邻近肝组织炎症(OR=1.703,P<0.05)均有关,且SNRPEP2高表达患者的总生存期(OS)、疾病特异性生存期(DSS)和无进展间隔期(PFI)均低于低表达患者(均P<0.05).多因素Cox回归分析显示SNRPEP2表达水平是影响HCC患者OS的独立危险因素(HR=1.970,P<0.01).ROC曲线分析显示SNRPEP2表达水平对于诊断HCC、T1期、M0期、病理分期I期,评估OS、DSS及PFI均具有良好的效能(均AUC>0.50).结论 SNRPEP2高表达是HCC预后不良的独立危险因素且具有良好的诊断效能,有成为HCC诊断和预后判断标志物的潜在应用价值.
文献关键词:
小核糖核蛋白多肽E假基因2;肝细胞癌;生物信息学;预后;诊断
中图分类号:
作者姓名:
别蓓蓓;周亚明;严成俊;孙晋
作者机构:
710125 西安培华学院医学院药学系;西安交通大学第二附属医院生物诊断治疗国家地方联合工程研究中心
文献出处:
引用格式:
[1]别蓓蓓;周亚明;严成俊;孙晋-.基于癌症基因图谱数据库分析SNRPEP2在肝细胞癌中的表达及其临床意义)[J].浙江医学,2022(10):1031-1037
A类:
SNRPEP2
B类:
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AB值:
0.230913
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