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典型文献
中国CVA6 D3基因亚型B细胞抗原表位氨基酸差异分析及VLPs初步制备
文献摘要:
目的:分析中国流行的柯萨奇病毒A6型(coxsackievirus A6,CVA6)D3基因亚型中的D3a和D3b分支序列结构蛋白B细胞抗原表位氨基酸差异性来优化设计CVA6病毒样颗粒(virus-like particle,VLP)疫苗。方法:对GenBank下载的含有P1区核苷酸CVA6序列,使用MEGA.11.0软件基于VP1序列采用最大似然法构建进化树划分基因型及亚型。采用在线工具WebLogo并结合CVA6 B细胞抗原表位研究的相关文献,对D3a和D3b分支序列VP1-VP3区B细胞抗原表位氨基酸差异性分析,为筛选疫苗候选株进行CVA6 VLP的制备。结果:D3a与D3b分支序列在VP1 N末端P27位点分别是天冬酰胺(96.2%)和丝氨酸(92.9%);在VP3 N末端P60位点为甘氨酸(98.8%)和丝氨酸(60.0%)。基于上述差异性选择具有D3a(VP3-N-P60)和D3b(VP1-N-P27)两分支序列共有的B细胞抗原表位D3a-JX2018(GenBank accession number:MN845862)作为疫苗候选株,并成功制备了CVA6 VLP。结论:本研究为疫苗候选株的选择提供了新的思路,为日后CVA6 VLPs疫苗和免疫诊断试剂的研发提供了基础。
文献关键词:
柯萨奇病毒A6型;基因亚型;氨基酸差异;B细胞抗原表位;病毒样颗粒疫苗
作者姓名:
李晓亮;王聪聪;王蕊;李冀琛;宋洋;路环环;肖金波;刘莹;宋敬东;刘一志;张勇;孙强;徐希柱
作者机构:
山东第一医科大学公共卫生与健康管理学院,济南 250024;中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 国家脊髓灰质炎实验室 国家卫生健康委员会生物安全重点实验室 国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室,北京 102206;潍坊医学院基础医学院 261053
文献出处:
引用格式:
[1]李晓亮;王聪聪;王蕊;李冀琛;宋洋;路环环;肖金波;刘莹;宋敬东;刘一志;张勇;孙强;徐希柱-.中国CVA6 D3基因亚型B细胞抗原表位氨基酸差异分析及VLPs初步制备)[J].国际病毒学杂志,2022(06):449-454
A类:
D3b,JX2018,MN845862
B类:
CVA6,基因亚型,抗原表位,氨基酸差异,VLPs,柯萨奇病毒,coxsackievirus,D3a,序列结构,结构蛋白,like,particle,GenBank,下载,MEGA,VP1,最大似然法,进化树,基因型,WebLogo,VP3,差异性分析,疫苗候选株,P27,天冬酰胺,丝氨酸,P60,甘氨酸,性选择,两分,accession,number,免疫诊断,诊断试剂,病毒样颗粒疫苗
AB值:
0.264428
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