典型文献
大豆RSC4抗病候选基因Glvma.14G204700的克隆及其生物信息学分析
文献摘要：
为明确大豆抗大豆花叶病毒(soybean mosaic virus,SMV)SC4株系的基因位点RSC4(resis-tance to SMV strain SC4,RSC4)的候选基因Glyma.14G204700在大豆不同抗性品种中的序列结构特征和保守结构域,以齐黄1号、科丰1号、大白麻和南农1138-2共4个大豆品种为材料,通过基因克隆获得大豆Glyma.14G204700基因的cDNA全长序列,并采用生物信息学方法分析其序列特征和编码蛋白的理化特性及结构特征.结果表明,大豆Glyma.14G204700基因在4个大豆品种中的cD-NA全长为4 719～4 776 bp,编码1 295～1 307个氨基酸,预测蛋白的分子量为148.38～149.33 kD,等电点为5.53～5.61,均为具较强亲水性的非分泌蛋白.Glyma.14G204700蛋白含有植物抗病基因家族蛋白的保守功能域——核苷酸结合域和富含亮氨酸重复结构域.该蛋白的二级结构主要由a-螺旋、无规则卷曲、延伸链和β-折叠组成,所占比例分别为59.45％～61.08％、28.65％～30.15％、8.11％～8.88％和1.61％～2.16％.启动子序列分析发现该基因含有脱落酸、低温及干旱等多种逆境胁迫响应元件.表明大豆RSC4抗病候选基因Glyma.14G204700在大豆不同抗性品种中具有不同的等位变异,优异等位变异的鉴定和开发可为抗SMV大豆育种提供基础材料.
文献关键词：
大豆;抗病基因;克隆;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
王大刚;陈圣男;杨勇;李杰坤;吴倩;胡国玉;黄志平
作者机构：
安徽省农业科学院作物研究所,安徽省农作物品质改良重点实验室,合肥230031;福建农林大学海峡联合研究院,福建农林大学资源与环境学院,福州350002
文献出处：
引用格式：
[1]王大刚;陈圣男;杨勇;李杰坤;吴倩;胡国玉;黄志平-.大豆RSC4抗病候选基因Glvma.14G204700的克隆及其生物信息学分析)[J].植物保护学报,2022(04):1013-1021
A类：
RSC4,Glvma,14G204700
B类：
候选基因,生物信息学分析,抗大,大豆花叶病毒,soybean,mosaic,virus,SMV,株系,基因位点,resis,tance,strain,Glyma,抗性品种,序列结构,保守结构域,大白,白麻,大豆品种,基因克隆,cDNA,全长,生物信息学方法,序列特征,编码蛋白,理化特性,bp,分子量,kD,等电点,亲水性,非分,分泌蛋白,植物抗病基因,基因家族,功能域,亮氨酸,二级结构,无规则,卷曲,折叠,启动子序列,序列分析,脱落酸,逆境胁迫响应,响应元,明大,优异等位变异,大豆育种
AB值：
0.332925
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