典型文献
肝细胞癌自噬相关基因预后模型与免疫状态相关性分析
文献摘要：
目的:探讨可预测预后的自噬相关风险模型对肝细胞癌(hepatocellular carcinoma，HCC)患者的生存时间的影响。方法:从TCGA数据库下载374个肝癌组织样本和50个正常肝脏组织样本的转录组和临床信息，筛选出差异表达的自噬相关基因(differentially expressed autophagy-associated genes, DE-ARGs)。经单因素Cox回归分析、LASSO回归分析筛选，构建预后风险模型，并绘制ROC曲线评估模型对HCC患者生存期的预测能力。利用CIBERSORT算法分析模型自噬相关基因的表达与免疫状态的关联性。结果:从肝细胞癌组织与正常肝组织中筛选出132个上调和9个下调的DE-ARGs。经单因素Cox回归分析、LASSO回归分析筛选出6个自噬相关基因(
SQSTM1、
BNIP1、
CDKN2
A、
ATG13、
ATG3和
PRKCD)。基于此构建肝细胞癌自噬相关基因预后模型，模型受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve，ROC)曲线的曲线下面积(area under roc curve，AUC)为0.926。模型高风险组与较低水平的免疫细胞(幼稚B细胞和CD8
+ T细胞)的浸润相关。
结论:基于6个自噬相关基因(
SQSTM1、
BNIP1、
CDKN2
A、
ATG13、
ATG3和
PRKCD)构建的预后风险模型可以有效的预测HCC患者的预后，并且为HCC的免疫治疗提供诊疗策略。
文献关键词：
自噬;肝细胞癌;预后模型;免疫浸润
中图分类号：
作者姓名：
樊宇琪;魏巍;王学颖;黄嘉欣
作者机构：
哈尔滨医科大学附属肿瘤医院纪委办公室，哈尔滨 158100;哈尔滨医科大学公共卫生学院营养与食品卫生学教研室，哈尔滨 150081;哈尔滨医科大学附属肿瘤医院 肿瘤学外科，哈尔滨 158100;哈尔滨医科大学附属肿瘤医院研究生部，哈尔滨 158100
文献出处：
引用格式：
[1]樊宇琪;魏巍;王学颖;黄嘉欣-.肝细胞癌自噬相关基因预后模型与免疫状态相关性分析)[J].国际免疫学杂志,2022(06):575-582
A类：
BNIP1,CDKN2
B类：
肝细胞癌,自噬相关基因,预后模型,免疫状态,预测预后,相关风险,hepatocellular,carcinoma,HCC,生存时间,TCGA,下载,肝癌组织,肝脏组织,转录组,临床信息,出差,差异表达,differentially,expressed,autophagy,associated,genes,DE,ARGs,Cox,LASSO,预后风险模型,生存期,预测能力,CIBERSORT,算法分析,肝组织,SQSTM1,ATG13,ATG3,PRKCD,受试者工作特征曲线,receiver,operating,characteristic,curve,area,under,roc,高风险组,免疫细胞,幼稚,CD8
,免疫治疗,诊疗策略,免疫浸润
AB值：
0.374346
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