典型文献
基于TNF家族基因的肝癌分型及预后模型的建立
文献摘要：
目的 为了能够识别获益于免疫治疗的肝癌患者及评估预后,亟需建立肝癌新分型与预后模型.方法 应用无监督聚类方法对TCGA-LIHC数据集中的肝癌样本进行分型,ssGSEA算法评估免疫细胞浸润能力,TIDE评分评估免疫治疗反应能力,应用COX与LASSO回归分析方法构建基于TCGA-LIHC数据集的风险评分模型,并在ICGC-LIRI-JP数据集中验证模型的准确性.结果 基于TNF家族基因的表达水平可以将肝癌患者分为TNF-A型与TNF-B型,分析发现TNF-A型预后好,免疫细胞浸润程度高,肿瘤突变负荷小,免疫逃逸能力弱以及对免疫治疗反应较好.利用两型的差异基因笔者构建了风险评分模型,其中模型的1年、3年和4年总生存期的曲线下面积(area under the curve,AUC)分别为0.758、0.789和0.768,验证集分别为0.674、0.713和0.710,证明预后模型具有较高的准确度,且高风险组患者预后差,具有较高的T分期及TNM分期.结论 基于TNF家族基因建立的肝癌新分型用来评估患者对免疫治疗的反应,并构建风险评分模型以预测肝癌患者的预后.
文献关键词：
肝细胞癌;免疫治疗;预后模型;分子分型;肿瘤坏死因子
中图分类号：
作者姓名：
吴白骏;刘恬;胡朝全
作者机构：
550004 贵阳,贵州 医科大学;646000 泸州,西南医科大学附属医院肿瘤科
文献出处：
引用格式：
[1]吴白骏;刘恬;胡朝全-.基于TNF家族基因的肝癌分型及预后模型的建立)[J].医学研究杂志,2022(12):44-51
A类：
B类：
家族基因,预后模型,免疫治疗,肝癌患者,评估预后,无监督聚类,聚类方法,TCGA,LIHC,ssGSEA,免疫细胞浸润,浸润能力,TIDE,治疗反应,反应能力,COX,LASSO,回归分析方法,风险评分模型,ICGC,LIRI,JP,验证模型,浸润程度,肿瘤突变负荷,免疫逃逸,差异基因,总生存期,area,under,curve,验证集,高风险组,TNM,肝细胞癌,分子分型
AB值：
0.340067
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