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选择性剪接事件预测急性髓系白血病患者生存并揭示免疫微环境特征
文献摘要:
目的 深入剖析选择性剪接(AS)事件与急性髓系白血病(AML)患者预后、肿瘤微环境的关系,对AML的机制研究、临床诊断、预后评估和免疫治疗具有重要意义.方法 Cox回归分析用于筛选AML患者预后显著相关的AS事件;最小收缩与选择算子(LASSO)回归分析过滤掉冗余AS事件防止模型的过度拟合来构建风险评分模型;受试者工作特征曲线(ROC)对模型预后预测效能进行评估;独立预后分析判断风险评分的独立预测能力;单样本基因集富集分析(ssGSEA)量化高低风险评分组的免疫微环境特征.结果 18099个AS事件被确认为预后相关AS事件;AS模型中高风险评分患者预后更差;1年、3年、5年预后预测AUC值分别为0.822、0.852、0.838;独立预后分析表明风险评分可作为独立预后因子;高风险评分组免疫细胞浸润水平和免疫评分更低.结论 AS预后模型能准确预测患者预后并评估免疫微环境特征,我们鉴定的几个核心分子,可能成为AML潜在的诊断和预后生物标志物,并为进一步的验证提供靶点.
文献关键词:
选择性剪接;急性髓系白血病;预后;免疫微环境
中图分类号:
作者姓名:
黄玉娟;钟芳敏;周莉;黄波;王小中;李静
作者机构:
南昌大学第一附属医院检验科,江西 南昌 330006;南昌大学第二附属医院检验科 江西省检验医学重点实验室,江西南昌 330006
文献出处:
引用格式:
[1]黄玉娟;钟芳敏;周莉;黄波;王小中;李静-.选择性剪接事件预测急性髓系白血病患者生存并揭示免疫微环境特征)[J].实验与检验医学,2022(01):4-7,17
A类:
B类:
选择性剪接,事件预测,急性髓系白血病,白血病患者,免疫微环境,环境特征,AML,肿瘤微环境,预后评估,免疫治疗,Cox,选择算子,LASSO,滤掉,过度拟合,风险评分模型,受试者工作特征曲线,预后预测,预测效能,预后分析,分析判断,预测能力,单样本,基因集富集分析,ssGSEA,低风险,预后因子,免疫细胞浸润,免疫评分,预后模型,准确预测,诊断和预后,预后生物标志物
AB值:
0.279934
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