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典型文献
肝细胞癌中免疫相关基因的预后作用
文献摘要:
目的 探讨肝细胞癌(HCC)患者免疫相关基因特征的潜在预后生物标志物.方法 从TCGA数据库下载原始肝细胞癌数据,执行单样本基因集富集分析计算每个样本的免疫活性.利用"GSVA"包和"hclust"包将HCC样本分成高和低免疫细胞浸润组.ESTIMATE算法对每个HCC样本中的肿瘤微环境进行评分."limma"包和维恩图确定有效的免疫相关基因.单因素Cox、LASSO回归和多因素Cox回归分析探索关键基因."rms"包建立列线图并绘制校准曲线.结果 与高免疫细胞浸润组相比,低免疫细胞浸润组中样本的肿瘤纯度更高,免疫评分、ESTIMATE评分和基质评分较低.高免疫细胞浸润组免疫成分更丰富,TIGIT、PD-L1、PD-1、LAG3、TIM-3、CTLA4和HLA家族的表达水平更高.多因素Cox回归分析显示4个免疫相关基因(S100A9、HMOX1、IL18RAP和FCER1G)被用来构建预后模型.与其他临床特征相比,该预后模型的风险评分被确认为独立的预后因素.结论 本研究确定了肝细胞癌免疫相关核心基因,可用于肝细胞癌的靶向治疗和免疫治疗.
文献关键词:
肝细胞癌;TCGA数据库;免疫基因;预后
作者姓名:
王珏;金宗睿;王维;易麒麟;王继龙;朱海;徐邦浩;郭雅;文张
作者机构:
530021 南宁,广西医科大学第一附属医院肝胆外科
文献出处:
引用格式:
[1]王珏;金宗睿;王维;易麒麟;王继龙;朱海;徐邦浩;郭雅;文张-.肝细胞癌中免疫相关基因的预后作用)[J].肿瘤防治研究,2022(06):599-605
A类:
IL18RAP
B类:
肝细胞癌,免疫相关基因,预后作用,HCC,基因特征,预后生物标志物,TCGA,下载,单样本,基因集富集分析,免疫活性,GSVA,hclust,免疫细胞浸润,ESTIMATE,肿瘤微环境,limma,维恩图,Cox,LASSO,分析探索,关键基因,rms,列线图,校准曲线,肿瘤纯度,免疫评分,TIGIT,LAG3,CTLA4,HLA,S100A9,HMOX1,FCER1G,预后模型,风险评分,预后因素,核心基因,靶向治疗,免疫治疗,免疫基因
AB值:
0.396372
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