典型文献
生物信息学预测与肝细胞肝癌患者预后相关的免疫相关基因
文献摘要：
目的 通过生物信息学分析预测肝细胞肝癌(HCC)患者预后免疫相关基因并建立预后预测模型.方法 通过差异分析鉴定HCC组织中的免疫相关基因,使用单因素、多因素比例风险回归模型(Cox)、套索算法(LASSO)建立风险预后预测模型.使用C指数、受试者工作特征(ROC)曲线、校准曲线和决策曲线评价预后模型的预测效能.此外,将风险评分用于患者分层进而评估不同风险水平患者的预后差异.结果 通过生物信息学分析,发现HCC患者至少存在1403个免疫相关基因,主要集中在免疫反应、适应性免疫反应、免疫球蛋白产生等生物过程以及细胞因子相互作用、趋化因子信号通路和同种异体移植排斥等通路.单因素Cox分析发现,53个免疫相关基因与预后相关,进一步通过LASSO和多因素Cox回归分析筛选出8个预后免疫相关基因,包括长链非编码RNA AC125238.1、细胞色素P450氧化酶1A2(CYP1A2)、纤胶凝蛋白3(FCN3)、肝癌衍生生长因子样蛋白1(HDGFL1)、脂质运载蛋白2(LCN2)、线粒体编码的细胞色素C氧化酶Ⅱ假基因12(MTC02P12)、肽基精氨酸脱亚氨酶3(PAD13)和G蛋白信号调节因子16(RGS16),同时建立了以风险评分为主的预后列线图.ROC曲线、校准曲线和决策曲线证实该模型具有良好的区分度、准确度和临床价值.此外,通过分层分析表明,风险评分较高的患者具有较差的预后.结论 本研究建立了一个基于8个免疫相关基因的预后列线图,有望成为预测HCC患者预后的可靠工具.
文献关键词：
肝细胞肝癌;免疫相关基因;列线图;预后
中图分类号：
作者姓名：
席子涵;田济铭;张玄;黄启超;陶开山
作者机构：
空军军医大学第一附属医院肝胆外科,陕西西安710032;兰州大学第一临床医学院妇产科,甘肃兰州730000;空军军医大学基础医学院生理与病理生理学教研室,陕西西安710032
文献出处：
引用格式：
[1]席子涵;田济铭;张玄;黄启超;陶开山-.生物信息学预测与肝细胞肝癌患者预后相关的免疫相关基因)[J].细胞与分子免疫学杂志,2022(09):769-775
A类：
AC125238,FCN3,HDGFL1,MTC02P12,PAD13,RGS16
B类：
肝细胞肝癌,肝癌患者,免疫相关基因,生物信息学分析,分析预测,HCC,预后预测模型,分析鉴定,Cox,套索算法,LASSO,受试者工作特征,校准曲线,决策曲线,预后模型,预测效能,风险评分,分用,层进,风险水平,预后差异,适应性免疫反应,免疫球蛋白,生物过程,趋化因子,同种异体移植排斥,长链非编码,细胞色素,P450,CYP1A2,胶凝,肝癌衍生生长因子,子样,脂质运载蛋白,LCN2,假基因,肽基,精氨酸,调节因子,列线图,区分度,临床价值,分层分析
AB值：
0.256354
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