首站-论文投稿智能助手
典型文献
肺腺癌患者代谢相关基因和免疫相关预后模型的建立
文献摘要:
目的:构建一个基于代谢相关基因(MRGs)的肺腺癌(LUAD)预测模型并分析肿瘤免疫微环境(TIME)与MRGs的关系.方法:从TCGA和GEO数据库下载LUAD的基因表达数据,Msign数据库提取MRGs,取交集得到LUAD患者MRGs表达矩阵和对应的临床数据.单因素COX回归分析和Lasso回归分析筛选出生存相关MRGs并据此构建风险预测模型.采用Kaplan-Meier曲线验证模型区分高低风险患者的能力,ROC曲线预测患者生存率的稳定性.对模型基因进行GO、KEGG富集分析和单样本基因集富集分析(ssGSEA)以评估相关通路活性和免疫细胞浸润水平.结果:构建并验证了一个基于MRGs的预后模型,该模型能较好地区分高低风险的LUAD患者,具有稳定的预测性能,并可在一定程度反映TIME.基于模型风险评分绘制的列线图可更准确地预测LUAD患者一、三、五年生存率,更方便临床使用.结论:本研究确定了一些有临床意义的MRGs,是LUAD患者生存率、TIME的潜在预测指标.基于这些基因构建的风险模型和列线图具有良好的预测性能.
文献关键词:
肺腺癌;代谢相关基因;预后;肿瘤免疫微环境;生物信息学
作者姓名:
邓彪;陈春源;黄裕锋;陈心铭;罗连响;梁柱
作者机构:
广东医科大学附属医院心胸外科,湛江524001;广东医科大学第一临床医学院,湛江524023;南方海洋科学与工程广东省实验室(湛江),广东医科大学海洋医药研究院,广东湛江海洋医药研究院,湛江524023
文献出处:
引用格式:
[1]邓彪;陈春源;黄裕锋;陈心铭;罗连响;梁柱-.肺腺癌患者代谢相关基因和免疫相关预后模型的建立)[J].中国免疫学杂志,2022(15):1851-1860
A类:
Msign
B类:
肺腺癌患者,代谢相关基因,免疫相关,预后模型,MRGs,LUAD,肿瘤免疫微环境,TIME,TCGA,GEO,下载,基因表达数据,交集,矩阵和,临床数据,COX,Lasso,风险预测模型,Kaplan,Meier,验证模型,低风险,单样本,基因集富集分析,ssGSEA,相关通路,免疫细胞浸润,预测性能,基于模型,模型风险,风险评分,列线图,临床使用,预测指标,风险模型
AB值:
0.304257
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。