典型文献
基于生物信息学分析CCNB1、ASPM和AURKA作为肝细胞癌预后标志物的潜力
文献摘要：
目的 本研究基于生物信息学分析,探寻肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)发生发展的枢纽基因,为HCC患者的预后提供潜在的生物标志物.方法 从GEO数据库下载两个肝细胞癌芯片数据(GSE14520和GSE46408),通过GEO2R筛选HCC组织和正常肝组织之间的差异表达基因(DEGs).利用STRING数据库构建DEGs的蛋白质互作(PPI)网络,并用Cytoscape软件的CytoHubba插件计算PPI中各基因的连接度,筛选出枢纽基因.通过利用ONCOMINE、GEPIA2、cBioPortal、GeneMANIA、DAVID6.8和TIMER数据库对筛选出的枢纽基因进行转录、翻译、生存情况和肿瘤免疫浸润相关性等方面的验证,并分析其是否具有作为HCC预后生物标志物的潜力.结果 筛选出3个枢纽基因(CCNB1、ASPM和AUR-KA),且均在HCC中高表达.生存分析表明这3个基因均与HCC患者的总体生存率和无病生存率显著相关.肿瘤免疫浸润分析结果进一步提示CCNB1、ASPM和AURKA可能是HCC潜在的预后标志物.结论 CCNB1、ASPM和AURKA可能是HCC发生发展的枢纽基因,具有成为HCC预后标志物的潜力.
文献关键词：
肝细胞癌;生物信息学;差异表达基因;预后标志物
中图分类号：
作者姓名：
蒲俊兴;何颖;陈娟娟
作者机构：
南昌大学第二附属医院检验科 江西省检验医学重点实验室,江西 南昌 330006;南昌大学公共卫生学院,江西 南昌330031
文献出处：
引用格式：
[1]蒲俊兴;何颖;陈娟娟-.基于生物信息学分析CCNB1、ASPM和AURKA作为肝细胞癌预后标志物的潜力)[J].实验与检验医学,2022(01):30-34,54
A类：
GSE46408
B类：
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AB值：
0.291618
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