目的 研究急性髓性白血病(AML)中的肿瘤相关转录因子和免疫基因预后价值与免疫细胞浸润的相关性,并构建比例风险回归模型.方法 通过单样本基因集富集分析(ssGSEA)鉴定了 29种免疫基因集的亚型.通过ESTIMATE算法计算免疫评分和基质评分.通过运用已知RNA转录本的相对子集识别细胞类型(CIBERSORT),用于评估TCGA数据集中不同AML样本中免疫细胞亚群的相对比例.差异表达分析用于获得差异表达基因,比例风险回归模型(COX模型)分析用于构建评估模型.结果 通过对ssGSEA的分析确定了两种亚型(免疫-低/高).通过ESTIMATE算法对TCGA数据库中AML数据集计算基质评分和免疫评分.根据免疫评分对数据分组得到免疫评分-低/高.基于已有的分组比较发现多种免疫组分和细胞浸润丰度差异有统计学意义,包括单核细胞、血浆细胞和幼稚B细胞(P＜0.05).通过差异表达分析获得差异表达的免疫基因和肿瘤相关转录因子.通过COX模型分析建立了包括6个基因的预测模型,曲线下面积(AUC)为0.785,表明该模型具有高灵敏度和特异度(3年期存活AUC=0.792,5年期存活AUC=0.832).相关性分析表明,模型基因表达水平和风险值与AML患者的存活、临床风险、FAB分型相关.结论 建立的免疫微环境生存相关的基因模型以评估AML患者的预后,分析了关键基因和AML临床特征之间的关系.拓展了对AML患者预后相关的免疫微环境相关基因的认识,有助于制定新的治疗策略和研究AML发生发展的潜在机制.

急性髓性白血病;骨髓免疫微环境;免疫浸润;TCGA;GTEX

中山大学附属第三医院血液内科,广东广州510630;中山大学附属第三医院中心实验室,广东广州510630

[1]黄福新;薛曼婕;赖文兴-.急性髓系白血病中骨髓免疫微环境预后模型的构建)[J].热带医学杂志,2022(04):495-500,后插2

骨髓免疫微环境

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