典型文献
自噬相关长链非编码RNA在肝细胞癌中的功能分析及预后模型构建
文献摘要:
目的:筛选在肝细胞癌(HCC)中具有预后价值的核心自噬相关长链非编码RNA(lncRNA).方法:选择癌症基因组图谱数据库(TCGA)和人类自噬数据库(HADb)进行生物信息学分析.以多因素Cox回归,最小绝对收缩和选择算子(Lasso)回归构建风险评分模型.模型的特异度和敏感度由受试者工作特征曲线(ROC)评估.相关生物学功能由Metascape数据库和基因集富集分析(GSEA)鉴定.结果:共鉴定了10个关键lncRNAs并据此构建风险评分模型.生存分析显示高风险组患者总生存期显著低于低风险组(P<0.001).该模型在预测HCC患者一年、三年、五年生存率方面表现良好,曲线下面积分别是0.810、0.751、0.736.多因素Cox回归表明,该模型是HCC的独立预后因素(HR=3.666,P<0.001).结论:本研究鉴定了10个自噬相关lncRNAs,并以之构建了1个用于HCC的预后风险模型,有望成为潜在的治疗靶点和新的预测指标.
文献关键词:
肝细胞癌;自噬;长链非编码RNA;计算生物学;预后
中图分类号:
作者姓名:
何莹;徐睿;扈晓宇
作者机构:
成都中医药大学附属医院感染科,成都610072
文献出处:
引用格式:
[1]何莹;徐睿;扈晓宇-.自噬相关长链非编码RNA在肝细胞癌中的功能分析及预后模型构建)[J].中国免疫学杂志,2022(08):975-981
A类:
B类:
自噬,关长,长链非编码,肝细胞癌,功能分析,预后模型,HCC,预后价值,癌症基因组图谱数据库,TCGA,HADb,生物信息学分析,Cox,最小绝对收缩和选择算子,Lasso,风险评分模型,受试者工作特征曲线,生物学功能,Metascape,基因集富集分析,GSEA,lncRNAs,生存分析,高风险组,总生存期,低风险组,独立预后因素,预后风险模型,治疗靶点,预测指标,计算生物学
AB值:
0.319018
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。