典型文献
香菇菌丝后熟转色的转录组分析
文献摘要:
香菇是世界第二大栽培食用菌,其菌丝后熟转色是其特有的栽培过程,并对其产量和品质至关重要.为了进一步了解香菇后熟转色形成的机制,本研究利用Illumina二代高通量测序平台,对初始未转色菌丝(LE 118)、光照下转色菌丝(LE313C)、黑暗下未转色菌丝(LE313W)进行转录组测序,以香菇单核体W1-26基因组为参考基因组进行转录组有参分析,共鉴定出2215个差异表达基因,LE313C比LE118、LE313C比LE313W、LE313W比LE118中分别有1216、1507、1054个基因差异表达.GO富集分析表明,差异表达基因显著富集碳水化合物代谢过程、氧化还原酶活性、水解酶活性、过氧化物酶活性等.KEGG分析发现芳香族化合物的降解在LE313C比LE313W中被显著富集.在LE313C比LE118即香菇菌丝后熟转色发育过程中,筛选出关键差异表达基因包括糖苷酶、疏水蛋白、P450、漆酶、谷氨酸脱氢酶等,表明这些差异基因在香菇菌丝的后熟转色中可能行使重要的生物功能.本研究为进一步研究香菇菌丝后熟及转色形成的机理提供了重要依据.
文献关键词:
香菇;转色;转录组;基因差异表达
中图分类号:
作者姓名:
储婷;尚俊军;管婉;杨瑞恒;鲍大鹏;唐利华
作者机构:
上海海洋大学食品学院,上海201306;国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业科学院食用菌研究所,上海201403
文献出处:
引用格式:
[1]储婷;尚俊军;管婉;杨瑞恒;鲍大鹏;唐利华-.香菇菌丝后熟转色的转录组分析)[J].菌物学报,2022(02):260-273
A类:
后熟转色,LE313C,LE313W,LE118
B类:
香菇,菌丝,转录组分析,食用菌,产量和品质,研究利用,Illumina,二代高通量测序,高通量测序平台,照下,黑暗,转录组测序,单核体,W1,参考基因,差异表达基因,基因差异表达,富集分析,碳水化合物代谢,代谢过程,氧化还原酶,水解酶活性,过氧化物酶活性,芳香族化合物,糖苷酶,疏水蛋白,P450,漆酶,谷氨酸脱氢酶,差异基因,能行,生物功能
AB值:
0.209003
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。