典型文献
整合转录组数据鉴定大型真菌原基形成的潜在通路
文献摘要：
[背景]大型真菌子实体发育特别是从菌丝体到原基转变的分子机制,目前仍不清楚.现有的研究大多集中在有限的真菌种类或环境因素上,但对在发育中起关键作用的基因提供的信息有限.[目的]研究大型真菌原基形成的分子机制.[方法]对11个物种及4个环境因子相关的转录组数据进行分析.[结果]与对照组相比,上调基因数量从白灵菇(Pleurotus tuoliensis)的325个到梅里克氏菌(Rickenella mellea)的2854个,下调基因数量从白灵菇的379个到圆环蜜环菌(Armillaria ostoyae)的3189个.根据gene ontology (GO)注释,前3个生物过程类别为氧化-还原过程、代谢过程和碳水化合物代谢过程.此外,细胞成分类别中膜整体成分、核、膜等显著富集.同样地,分子功能类别包括水解酶活性、氧化还原酶活性和催化活性.[结论]大型真菌在原基形成中存在可能发挥重要作用的共同通路.
文献关键词：
大型真菌;转录组测序;原基形成;环境因子
中图分类号：
作者姓名：
杨驰;马璐;肖冬来;江晓凌;刘晓瑜;应正河;林衍铨
作者机构：
福建省农业科学院食用菌研究所,福建福州350012;特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心,福建福州350012
文献出处：
引用格式：
[1]杨驰;马璐;肖冬来;江晓凌;刘晓瑜;应正河;林衍铨-.整合转录组数据鉴定大型真菌原基形成的潜在通路)[J].微生物学通报,2022(02):556-568
A类：
tuoliensis,Rickenella,ostoyae
B类：
转录组数据,大型真菌,原基形成,菌子,子实体发育,菌丝体,多集,菌种,环境因子,白灵菇,Pleurotus,梅里,里克,mellea,圆环,蜜环菌,Armillaria,gene,ontology,生物过程,还原过程,代谢过程,碳水化合物代谢,细胞成分,分类别,中膜,体成分,样地,水解酶活性,氧化还原酶,催化活性,转录组测序
AB值：
0.359486
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