典型文献
玫烟色棒束孢(Isaria fumosorosea)侵染小菜蛾的表达谱分析
文献摘要:
[背景]昆虫病原真菌对寄主的侵染是一个十分复杂的过程,是多基因共同作用的结果.玫烟色棒束孢(Isaria fumosorosea)IFCF01菌株对小菜蛾具有很高的致病力,然而有关玫烟色棒束孢对小菜蛾致病的相关基因少见报道.[目的]筛选玫烟色棒束孢侵染小菜蛾相关基因,为更好地利用玫烟色棒束孢防治小菜蛾提供基因靶点.[方法]采用第二代高通量测序技术RNA-Seq,对玫烟色棒束孢侵染小菜蛾2-3龄幼虫4、8、12、16、24、30、36 h的虫菌混合样品(处理组)及纯培养玫烟色棒束孢(对照组)进行测序分析并筛选差异表达基因,结合生物信息学方法分析差异基因涉及的功能模块和信号通路.[结果]玫烟色棒束孢侵染小菜蛾混合样品与纯培养玫烟色棒束孢对照组对比分析共获得28 384个差异基因,其中显著差异表达基因274个,上调表达118个,下调表达156个.筛选获得的显著差异表达基因,特别是上调表达基因可能与玫烟色棒束孢对小菜蛾的侵染有关.GO二级分类显示,差异表达基因能够注释到36个GO条目中,包含18个生物学过程、9个细胞组分和9个分子功能.KEGG通路分析显示共有171个差异表达基因(differentially expressed gene,DEG)注释到132个通路中,其中有66个DEG显著富集在14个通路中.这些显著差异表达基因中大部分为玫烟色棒束孢侵染过程中潜在致病毒力相关基因.[结论]本研究为筛选玫烟色棒束孢侵染小菜蛾致病相关基因提供重要数据库,也为阐明玫烟色棒束孢对小菜蛾的侵染机制提供基础.
文献关键词:
玫烟色棒束孢;小菜蛾;侵染相关基因;转录组
中图分类号:
作者姓名:
谢梅琼;王龙江;何余容;吕利华;顾家睿
作者机构:
宜春学院生命科学与资源环境学院江西省作物生长发育调控重点实验室,江西宜春336000;宜春学院化学与生物工程学院,江西宜春336000;华南农业大学植物保护学院,广东广州510642;广东省农业科学院植物保护研究所,广东广州510640
文献出处:
引用格式:
[1]谢梅琼;王龙江;何余容;吕利华;顾家睿-.玫烟色棒束孢(Isaria fumosorosea)侵染小菜蛾的表达谱分析)[J].微生物学通报,2022(03):975-990
A类:
IFCF01,侵染相关基因
B类:
玫烟色棒束孢,Isaria,fumosorosea,小菜蛾,表达谱分析,昆虫病原真菌,寄主,一个十,十分复杂,多基因,致病力,见报,基因靶点,第二代高通量测序,高通量测序技术,Seq,幼虫,混合样品,纯培养,测序分析,差异表达基因,生物信息学方法,差异基因,功能模块,共获,染有,分类显示,条目,生物学过程,通路分析,differentially,expressed,gene,DEG,侵染过程,毒力相关基因,重要数据,侵染机制,转录组
AB值:
0.219711
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