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典型文献
不同发育时期蓝果忍冬果实的转录组分析
文献摘要:
为研究不同发育时期(绿熟期和成熟期)蓝果忍冬果实基因的表达差异,探索蓝果忍冬在生长发育过程中的关键代谢通路,以'中科蓝1号'蓝果忍冬品种为研究对象,利用高通量测序技术对蓝果忍冬绿熟期和成熟期果实的转录组数据进行比较分析.结果表明,共有40.32 Gb Clean Data,每个样品Clean Data均大于6.07 Gb,Q30碱基百分比均在93.89%及以上,GC含量为46.32%-49.38%;两个发育时期的果实共检测出3247个差异表达基因,包括1642个上调基因和1605个下调基因;GO功能富集分析发现,蓝果忍冬果实发育过程中的关键调控基因主要参与代谢、细胞和细胞组分以及催化过程;KEGG富集分析发现,差异表达基因主要富集在植物激素信号转导、碳代谢和氨基酸生物合成等途径.该结果为进一步研究蓝果忍冬果实发育过程中的动态变化提供了参考,为后续开展蓝果忍冬功能基因鉴定、遗传多样性分析等研究提供理论依据.
文献关键词:
蓝果忍冬;’中科蓝1号’;果实;转录组;差异表达基因
作者姓名:
孙燕;王金刚;臧丹丹;赵恒田;刘淑华
作者机构:
东北农业大学园艺园林学院,哈尔滨 150030;中国科学院东北地理与农业生态研究所黑土区农业生态重点实验室,哈尔滨 150081
文献出处:
引用格式:
[1]孙燕;王金刚;臧丹丹;赵恒田;刘淑华-.不同发育时期蓝果忍冬果实的转录组分析)[J].生物技术通报,2022(12):204-213
A类:
B类:
不同发育时期,蓝果忍冬,冬果,转录组分析,成熟期,表达差异,关键代谢通路,高通量测序技术,转录组数据,Gb,Clean,Data,Q30,碱基,差异表达基因,功能富集分析,果实发育,调控基因,催化过程,植物激素,激素信号,信号转导,碳代谢,生物合成,功能基因,基因鉴定,遗传多样性分析
AB值:
0.249063
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